三代测序不技术发展及其他.pptx

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三代测序不技术发展及其他

三代测序技术发展及它;第一代测序技术;Dideoxynucleotides(双脱氧核苷酸);Sanger双脱氧终止法;Sanger第一步:加入复制终止剂;ddNTPs参与下的DNA复制;Sanger第二步:荧光检测;Gel Electrophoresis DNA Fragment Size Determination;关于ABI3730xl;长片段的测序;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;基于ABI3730xl平台的扩展应用;第二代测序平台; 454 (GS-FLX);GS FLX系统的流程概括起来,就是“一个片段 = 一个磁珠 = 一条读长(One fragment = One bead = One read)”。 1)样品输入并片段化:GS FLX系统支持各种不同来源的样品,包括基因组DNA、PCR产物、BAC、cDNA、小分子RNA等等。大的样品例如基因组DNA或者BAC等被打断成300-800 bp的片段;对于小分子的非编码RNA或者PCR扩增产物,这一步则不需要。短的PCR产物则可以直接跳到步骤3)。 ;2)文库制备:借助一系列标准的分子生物学技术,将A和B接头(3’和5’端具有特异性)连接到DNA片段上。接头也将用于后续的纯化,扩增和测序步骤。具有A、B接头的单链DNA片段组成了样品文库。 3)一个DNA片段=一个磁珠:单链DNA文库被固定在特别设计的DNA捕获磁珠上。每一个磁珠携带了一个独特的单链DNA片段。磁珠结合的文库被扩增试剂乳化,形成油包水的混合物,这样就形成了只包含一个磁珠和一个独特片段的微反应器。 ;4)乳液PCR扩增:每个独特的片段在自己的微反应器里进行独立的扩增,而没有其他的竞争性或者污染性序列的影响。整个片段文库的扩增平行进行。对于每一个片段而言,扩增后产生了几百万个相同的拷贝。随后,乳液混合物被打破,扩增的片段仍然结合在磁珠上。 ; ;454 (GS-FLX); ; Genome Analyzer技术的基本原理; Genome Analyzer技术的基本原理; Genome Analyzer技术的基本原理; Genome Analyzer系统的优势; ;SOLID工作流程;SOLID工作流程;SOLiD 4-color ligation reaction;SOLiD 4-color ligation reaction;SOLiD 4-color ligation reaction;SOLiD 4-color ligation reaction;SOLiD 4-color ligation reaction;SOLiD 4-color ligation reaction;优势: 系统可扩展性 最大的灵活性 全基因表达图谱分析 更多RNA研究 SNP分析 甲基化分析;第三代测序技术;HeliScope;HeliScope;PacBio-SMRT;PacBio-SMRT;PacBio-SMRT;PacBio-SMRT;PacBio-SMRT;Oxford Nanopore Technologies;小结:;小结:;Thanks for your attention!

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