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吉林大学高性能计算中心 机群用户手册 V2015 Hmyu 2015/12/18 JLUHPCC 机群用户手册v2015 一、 系统硬件信息 截至2014 年3 月，中心整体计算能力50TFlops，存储能力272TB。 中心的高性能计算平台具有高性能、高密度、绿色节能等优点。系统 规模根据校内用户调研结果按需而定，综合平衡各项性能，具有很高 的性价比和适用性。 吉林大学高性能计算平台 计算能力 60TFlops 150 片双子刀片：每刀片含两台独立的计算节点，每节点配 置2 颗Intel Xeon X5650 CPU ，24GB ECC 内存 10 片双子刀片：每刀片含两台独立的计算节点，每节点配 置2 颗Intel Xeon X5650 CPU ，48GB ECC 内存 40 片独立刀片：每刀片一个计算节点,配置2 颗Intel Xeon E5-2692V2 ，64GB ECC 内存 计算节点 8 片独立刀片：每刀片一个计算节点,配置2 颗Intel Xeon E5-2650 ，32GB ECC 内存（曙光） 2 台胖节点：每节点含4 颗Intel Xeon E7520 CPU ，96GB ECC 内存，8*1T SATA 硬盘 4 台胖节点：每节点含4 颗Intel Xeon E7-8837 CPU ，96GB ECC 内存，8*1T SATA 硬盘 6 台登录节点，每节点2 颗 Intel Xeon X5650 CPU ，24GB 登录节点 ECC 内存 CPU 核数 5088 核 磁盘总容量 272TB 计算网络 Mellanox QDR Infiniband(40Gb) 操作系统 RedHat Linux AS 5.5+6.3 x86_64 版本 文件系统 LUSTRE 并行文件系统1.8.5+2.3 作业调度系统 Platform LSF HPC 7 Update 6 -1- Build by Hmyu JLUHPCC 机群用户手册v2015 二、 系统环境设置 1. 环境变量设置脚本 环境变量设置脚本的用途是告诉系统相关的应用程序及程序依 赖的lib 文件(.a 或.so)所在的位置。 /data1/env 下的预定义环境变量脚本 文件名 用途 environments Intel 11 的编译器和MKL 以及Intel MPI3.2.2 的环境变量设置 intel4 Intel 11 的编译器和MKL 以及Intel MPI4.0.3 的环境变量设置 gnu47 GNU4.7.3 编译器环境变量设置 gnu48 GNU4.8.2 编译器环境变量设置 icompiler11 Intel 的编译器11.1.072 ，只含编译器环境变量设置 Intel 的编译器13.1.1 ，含编译器环境变量设置和MKL 13.1.1 的环 icompiler13 境变量设置 openmpi1.6_gnu OpenMPI1.6.5+GNU compiler4.8.2,编