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可变剪切有组织特异性-科学网
可变剪切对基因进化模式和功能的影响 张亮生 zhangbio@ 动植物存在大量的可变剪切 人体不同组织中,95%的多外显子基因存在可变剪切 水稻48%的基因存在可变剪切 可变剪切有组织特异性 How,what,and why??? Pan, et al Nature Genetics, 2009 Lu, et al Genome Res, 2010 已知可变剪切的功能 可变剪切调控基因的功能 基因的可变剪切导致疾病的发生 在基因进化过过程中可变剪切起着重要的作用 还有其他功能??? 用新一代测序对基因注释 新一代测序技术是发现可变剪切的有效手段 可变剪切注释策略 1.全长基因和cDNA同时Mapping 2.设计算法? 参数:Mismatch等等 数据库? 基因复制(进化)与可变剪切 重复基因的可变剪切分析 (1).Segmental duplication (2).Tandem duplication (3).Retroposition 单拷贝基因可变剪切情况 外显子化 基因可变剪切事件的起源和演化 可变剪切与基因家族 那些基因家族容易发生可变剪切,可变剪切在不同基因家族中有偏好性? 成员多的基因家族容易发生可变剪切? 那些功能基因容易发生可变剪切? 非常谢谢大家的聆听 科学网博客:/u/zls111/ Google 张亮生
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