微生物分类年.ppt

第一节 通用分类单元 第二节 微生物在自然界的地位 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 第四节 微生物分类鉴定的方法 第一节 通用分类单元 分类是认识客观事物的一种基本方法。我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对他们进行分类。 分类学内容涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类、命名和鉴定。 分类（classification）是根据一定的原则（表型特征相似性或系统发育相关性）对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便考察和对未被分类的微生物进行鉴定； 命名（nomenclature）是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； 鉴定（identification或determination） 则是指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、新发现的或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 一.分类单元及其等级 界Kingdom 门Phylum——亚门 纲Class——亚纲 目Order——亚目 科Family——亚科 属Genus 种Species 新名称的发表 根据细菌命名法规的规定，有效发表新的细菌名称应在公开发行的刊物上进行，在菌种目录、会议记录、会议论文摘要的均不能视为有效发表。此外，若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合格发表，也不能取得国际上的承认。 发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。 常用的细菌分类术语 培养物（culture),是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。 种（species),是生物分类中基本的分类单元和分类等级。是一大群表型特征高度相似，亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有明显差异的一大群菌株的总称。 型（form或type),常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。 第二节 微生物在自然界的地位 1、两界系统 动物界 Animalia：不具细胞壁，可运动，不进 行光合作用。 植物界 Plantae：具有细胞壁，不运动，可行光合作用。 三界：原生生物界 Protista：（E. H. Haeckel, 1866年提出）  2、五界系统 R. H. Whitakker, Science, 163: 150-160, 1969原核生物界 Monera：细菌、放线菌等原生生物界 Protista：藻类、原生动物、粘菌等真菌界 Fungi：酵母、霉菌动物界 Animalia：植物界 Plantae：五界系统是以细胞结构分化的等级以及和光合、吸收、摄食这三种主要营养方式有关的组织类型为基础的。六界：加上病毒界。 3.三界（域）系统  Woese用寡核苷酸序列编目分析法对60多株细菌的16SrRNA序列进行比较后发现：产甲烷细菌完全没有作为细菌特征的那些序列，于是提出了生命的第三种形式-古细菌(archaebacteria)。随后对包括某些真核生物在内的大量菌株进行了16Sr RNA(18SrRNA)序列的分析比较，又发现极端嗜盐菌和极端嗜酸嗜热菌也和产甲烷细菌一样， 具有既不同其他细菌也不同于其核生物的序列特征，而它们之间则具有许多共同的序列特征。 三界(域)为： Bacteria(细菌)、Archaea(古生菌)和Eukarya(真核生物)。 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 菌种鉴定的共同步骤： 获得该微生物的纯培养物 测定必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 1、 API 细菌数值鉴定系统 2、 Enterotube 系统 3、 Biolog 全自动或手动细菌鉴定系统 2、Enterotube 系统 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 80年代以前螺菌属(Spirillum)不同的G+C含量高达38%～66%,后来伯杰氏手册(1984)结合其他特征已将其分为三个属:螺藻属、海洋螺菌属(Oceanospirillum)和水螺菌属(Aquaspirillum),它们的G+C