蛋白质组与蛋白质组学课件.pptVIP

* * * * * * Take Home Message: Amino Acids are the fundamental building blocks of proteins and have certain common properties. * Take Home Message: the very different chemical properities of each of the amino acids contribute to the very complicated structures and very different functions of proteins For your integrated assignment it will be interesting to think about how these groupings of amino acid side chain properties relate to the evolution of amino acyl tRNAs in your organism. * Take Home Message: Peptide bond is flat structure around which the bonds can rotate, allowing the protein to rotate or fold into more complicated structures * * 蛋白質構形 是由胺基酸連接起來，然後一級一級堆疊上去，共有四個層次。不過，注意這種四級構造的區分是人為的，胺基酸不會先連成一條長鏈，先繞成 a helix 或 b sheet，接好雙硫鍵後形成三級構造，再組合成四級構造。其實，蛋白質構形的正確摺疊過程，可能遠比我們所能想像的要複雜，幾乎一開始轉譯出一小段胜就馬上進行摺疊，其中還需要一些蛋白質的協助，統稱為 chaperone，以及多種轉譯後的修飾。 然而，由胺基酸組成蛋白質後，原本只是一般化學物質的胺基酸，開始變成具有某種生物『活性』的蛋白質或酵素，有些酵素還知道如何進行其自身活性的調節，已經是接近有『智慧』了；以蛋白質為成份之一，再進一步組合成細胞，則真正具有了生命。因此，胺基酸與蛋白質之間，似乎是『生物』與『無生物』之間的臨界點。 你認為這個臨界點在哪裡？ * 當然 所有的生物資訊，最後都藏在細胞的核酸之中，胺基酸序列是由 DNA 經過 RNA 所轉譯出來的。當基因體計畫完成之後，Central Dogma 的視野頓時開闊，將其套在全體基因上，轉錄出表現中的全體 RNA 稱為 transcriptome，後者轉譯成全體蛋白質則稱『蛋白質體 proteome』。要注意隨著表現時期、器官與環境的不同，同一基因體可以表現出不同的蛋白質體。 基因體或蛋白質體的概念，強迫科學家改以巨觀的角度，去考慮整個細胞或生物的表現情形；配合以前針對個別基因或蛋白質的單點深入，可提供研究工作另一完全不同的觀點與思考方式。 我在一門給非生物科系的通識課程上，宣稱『基因決定生命的一切特質』因而引起軒然大波；許多同學先是震驚，然後表示無法認同 (不一定是宗教理由)，並反問許多問題，例如『那教育何用？ 』 你認為如何？ * Graphical representation: highlighting how a polymorphism within a particular gene will result in a change in a biological response---not necessarily a response leading to toxicity! One of the issues with the method-what does a change in gene expression really mean? * * * * * * * * * * * I start by explaining glycomics – the fast emerging filed for the study of carbohydrate structure and function. Carbohydrate molecules get attached to proteins at specific cellular environment – this process is termed glycosylation. Let us see a schematic representation of a glycopeptide