第四章 蛋白质及蛋白质组.pptVIP

第四章 蛋白质及蛋白质组 一 蛋白质对生命的重要性 二 蛋白质的构件分子——氨基酸 三 蛋白质分子的基本结构及其与功能的关系 四 蛋白质分子的空间结构及其与功能的关系 五 蛋白质的单体缔合、超分子装配及蛋白质—— 蛋白质、蛋白质——DNA相互作用 六 蛋白质组 第一节 蛋白质对生命的重要性 Protein Berzelius 1938 蛋白质是生命的物质基础，一切生命活动离不开蛋白质 蛋白质称为功能分子或工作分子（working molecules） 1 催化功能蛋白质 酶 2 保护和支持功能蛋白质 胶原蛋白 3 激素蛋白质 4 运输功能蛋白质 血红蛋白 载脂蛋白 白蛋白 5 运动功能蛋白质 肌球蛋白 肌动蛋白 6 免疫防御功能蛋白质 IgG MHC HLA 7 凝血功能蛋白质 凝血因子 8 基因表达调控功能蛋白质 组蛋白 9 识别功能的受体蛋白质 10 信号转导蛋白 G蛋白 11 通道蛋白 离子通道 运载蛋白 12 周期蛋白 cyclin 9类16种 Cdk (cyclin dependent kinase) 7种 阻遏蛋白 13 凋亡蛋白 apoptin 凋亡蛋白活化因子Apaf Bcl-2 caspases 14 其他蛋白质 第二节 蛋白质的构件分子——氨基酸 蛋白质的元素组成和分子量 相对分子量 Mr 上万 C、H、O、N、S Fe、P、Zn、Mn、Cu、I N含量16% 一、氨基酸的分类 自然界存在300多种氨基酸 组成蛋白质的一般只有20种氨基酸 L，?-氨基酸 没有种族差异和个体差异 21 UGA ? SertRNA ? Ser ? 硒代cys (Selenocysteine) (含硒蛋白质） (1) I Chambers, J Frampton, P Goldfarb rt al. EMBO J. 1986,5: 1221-1227. (2) F Zinoni, A Birkmann, T C Stadtman et al . Proc. Natl. Acad. Sci.U.S.A. 1986, 83:4650-4654. 22 UAG ? 吡咯Lys (pyrrolysine)（巴氏甲烷八叠球菌） (3) G Srinivasan, C M James, J A Krzycki. Science. 2002, 296:1459-1462. (4) B Hao, W Gong, T K Ferguson et al. Science. 2002, 296:1462-1466. 生物化学分类 酸性 Asp Glu 碱性 Arg Lys His 极性 Ser Thr Cys Tyr Asn Gln Trp Met 中性 非极性 Gly Ala Val Leu Ile Phe Pro 氨基酸按?-螺旋与?－折叠结构形成的难易程度进行分类 强形成 易形成 弱易形成 中立作用 易破坏形成 强破坏形成 Glu Lys Asp Arg Tyr Pro Met Phe His Thr Asn Gly ?-螺旋 Ala Gln Ser Leu Trp Cys Ile Val Val Phe Arg Ser Pro