16SrRNA基因在细菌菌种鉴定中的应用Applicationof16S-食品科学.PDF

《乳业科学与技术》 年第 期 (总第 期) 2006 5 120 207 !!!!!! 乳 品 综 述 ! ! !!!!!! 16SrRNA基因在细菌菌种鉴定中的应用 都立辉,刘 芳 (东北农业大学乳品科学教育部重点实验室,哈尔滨 ) 150030 摘 要:本文综述了应用 16SrRNA基因作为靶基因对细菌进行鉴定的各种分子生物学技术,并指出 应用 16SrRNA基因在乳酸菌鉴定方面的研究进展。 关键词: ;细菌;鉴定 16SrRNA 中图分类号: 文献标识码: 文章编号: Q939.1 A 1671-5187(2006)05-0207-03 Applicationof16SrRNAGeneinIdentificationofBacteria DuLihui,LiuFang (KeyLabofDairyScienceofMinistryofEducation,FoodScienceTechnologyofNortheast AgriculturalUniversity,Harbin150030,P.R.China) Abstract:Thepapersummerizedthemolecularapproachesfortheidentificationofbacteriabyusing the16SrRNAgene,andpointedoutthedevelopmentoftheidentificationofLAB. Keywords:16SrRNA;bacteria;identification 在细菌的系统分类学研究中最有用的和最常 出来,利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种 用的分子钟是 ,其种类少、含量大 约占细菌 的细菌进行分类鉴定。但较其它方法而言, rRNA ( 16S 含量的 ,分子大小适中,存在于所有的 序列测定分析更适用于确定属及属以上分 RNA 80%) rRNA 生物中,特别是其进化具有良好的时钟性质,在结 类单位的亲缘关系。 构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石” 之称。rRNA是细菌和真核细胞核糖体的基本组 成部分,编码rRNA的基因是按5′-16S-23S-5S- 方式排列的,由两个非编码的间隔区序列所分 3′ 开。 、 、 三部分组成 16SrDNA23SrDNA5SrDNA 一个RNA操纵子,这个操纵子作为一个单位进 116SrRNA基因鉴定的方法 行转录。转录后处理成为成熟的 、 和 16S23S 5S 1.116SrRNA基因直接测序法 。 结构既具保守性又具高变性。保守 rRNA rRNA 对微生物 16SrRNA基因进行测序时最好进 性反映生物物种的亲缘关系,高变性则揭示生物 行全长测序,尤其是所测序列将要用于探针设计 物种的特征核酸序列,是属种鉴定的分子基础。 和新物种确定时。另外,采用正反向引物对所测序 16SrRNA基因大小适中,约 1.5Kb