课件：全基因组检测与遗传病筛查.ppt

* * * Autism 孤独症谱系--智力落后 1.8 AUTS8 位于3号染色体的长臂(3@5一q27)区域。Auranen等(2002)在对38个芬兰孤独症家系的研究中发现1/3先证者的直系亲属有艾斯伯格综合征或进行性吞咽困难。在对其中19个只有孤独症患者的家系的研究中发现了3q25一q27与孤独症的连锁。在D3S3037处得到的最大两点LOD值为3.16，另外包含艾斯伯格综合征的l8个家系的I 0D值为4.3l。 　　l.9 AUTS9 位于7号染色体的长臂(7q31)区域。国际孤独症分子遗传学研究协会(1998)对87个患病同胞对和12个非患病同胞对共99个家系进行了研究，在6条染色体同时得到了多个最大L0D值 1的区域，其中7q3l一(t34最为明显。只用其中的87个患病同胞对进行分析时，在D7S53O和D7S684区域得到最大I OD值为2.53 。Lamb等(2005)在对219个受累同胞对的研究中发现了7q上的两个连锁位点，分别为D7S477和D7$530与D7S640之间的区域。D7$530多点连锁分析最大I.OD值为2.31;又增加了145个男性同胞对后，L0D值在D7S480与D7S530区域增至2.55。这提示基因印记在孤独症的发生中有重要作用 。Trikalinos等(2006)对9项孤独症或孤独症谱系疾病基因组扫描研究做了荟萃分析，得出7q22一q32与孤独症有明显连锁。 　　1.10 AUTS1l 位于l号染色体的长臂(1q24)区域。Buxhaum 等(2004)对62个至少有两名孤独症或孤独症谱系疾病患者的家系进行了研究，家系的选择依据患者是否有强迫观念与行为。研究发现1q24.2与孤独症有连锁，在D1S1 65l处的多点I OI)值为3.O6，两点非参数LOI)值为3.21.连锁位点位于I)1$547与D1$346之间 。Barlett等(2005)用后验概率连锁(posterior probability linkage PPI )也得出l(t23一q24区域与孤独症有明显连锁 。 　　 Autism 孤独症谱系—美国患病率在1‰～2‰。 1.11 AUTsl0、l2 分别位于7号染色体的长臂(7q36)与2l号染色体的21pl3一q1l区域。Molly等(2005)对34个除有一名孤独症患者外.还有～孤独症或孤独症谱系疾病亲属、且二者均有退行性病史的家系进行了金基因组分析，发现7q35一q36与孤独症有明显连锁，在I)7S483附近得到非参数I OD值为3.7，最大多点I OD 值为2.0。此外.此表型亚群与21p13一ql1也呈现连锁.在21pl3一ql1区域的D21S1437位点非参数LOD值为3.0.最大多点LOD值为3. 　　1.12 AUTSt3 位于l2号染色体的长臂(12q14)区域。Ma等(2007)在对有6 名孤独症患者的26个家系的研究中12ql4.2与孤独症连锁，在rslt45442处得到多点非参数LOD值为3.O2。当用仅有男性患者的家系分析时，LOD值增至4.5l，表明性别与患病之问存有特定关系。 　　1.13 AUTS14 位于l6号染色体的短臂(16pl1.2)区域。Weiss等(2008)在对7j1个孤独症家系拷贝数变异(copy nunJ~er variations CNV)研究中发现7个来自不同家系(At~lism Genetic Resource Ex—change AGRE)的患儿有缺失或重迭，其中丽个患儿的改变是遗传自父母。通过一系列研究，最终将这个缺失和重迭区域定位于l 6pl1.2，并且发现1% 的孤独症.与此位点关联l、： 。Marshall等(2008)通过基因芯片技术在 127个孤独症谱系疾病家系中发现189(44 )个家系有277个不平衡CNV，而这些CNV并没有出现在正常人中。虽然大部分CNV是遗传自患音父母，但其中27个为新改变。4名忠哲在l6pl 1.2区域的CNV 在对照组未出现。 　　1.14 AUTSI5位于7号染色体的长臂(7q35一q36)区域。Alarcon等一o 9年，对l 2个家系进行了孤独症三个亚型的分类.包括：“说第一个字的年龄”、“说 一句短语的年龄”、“承复与刻扳行为”，并n进行了非参数多极连锁分析.结果显示“说第一个字的年龄”与7q35一q36相连锁.并认为在孤独症“说第一个字的年龄” Autism 孤独症谱系—诊断主观（患病率3～4/万--深圳高达1.32%。） 、“说第一句短语的年龄”与7 c1牛f1连锁 “。后来征2005年又增加丁样本最，仍然重复出了上述结果。 　　1.1 5 AU ISX1 位于X染包体的短臂(Xpl 3)区域。Auranen等(2002)对38个芬兰孤独症潞系疾病家系进行了