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西南科技大学硕士研究生学位论文第
西南科技大学硕士研究生学位论文
第 I页
摘 要
微生物在多种碳源存在的情况下,优先选择优势碳源而抑制非优势碳源的利 用,这种现象称为碳代谢物抑制。在假单胞菌中,全局调控因子 Crc 被认为是参 与碳代谢抑制调控的核心蛋白,可通过与靶标基因的 mRNA 互作进而发挥调控作 用。近年来,有研究认为 RNA 分子伴侣 Hfq 参与了 Crc 与靶标 mRNA 的分子互 作,Hfq 可通过与 mRNA 分子的互作进而调节其稳定性目前关于两种不同的学术 观点仍存在争议,而 Hfq 和 Crc 在固氮菌中的研究尚未见报道。固氮施氏假单胞 菌 A1501 分离自水稻根际,如何高效利用根际环境中复杂的碳源对该菌的根际定 殖及环境适应至关重要,但是该菌中 Crc 与 Hfq 蛋白在碳源利用调控过程中的功 能及其协同作用缺乏分子证据。本研究在实验室已有 hfq 突变株和 crc 突变株基础 上,通过 hfq 和 crc 双突变株的构建,重点分析了 Hfq 和 Crc 在混合碳源利用中的 生理生化表型,初步研究了 Hfq 及 Crc 在碳代谢调控中的作用机制,取得了以下 结果:
1、研究了 Hfq 和 Crc 蛋白在碳代谢途径中的生物学功能。分别测定了 hfq 和 crc 单突变株和双突变株在单一碳源及混合碳源(优势碳源与非优势碳源混合)条 件下的生长能力,结果发现,在优势碳源(乳酸钠和琥珀酸)为单一碳源条件下, 突变株与野生型的生长能力均无显著差异,而在两种非优势碳源(苯甲酸和葡萄 糖)为唯一碳源条件下,crc 和 hfq 单突变株生长能力显著下降,而双突变株基本 不能生长。在优势碳源乳酸钠与非优势碳源苯甲酸混合培养条件下,crc 和 hfq 单 突变株生长能力增强,而双突变株生长能力较弱。以上结果表明,在非优势碳源 存在的情况下(无论单一碳源或混合碳源),crc 和 hfq 双突变株产生的表型变化水 平都显著强于单突变株,暗示两者可能存在功能上的叠加。以苯甲酸代谢为研究 对象,通过实时定量 RT-PCR 分析了苯甲酸存在条件下(单一、混合碳源)苯甲酸 降解关键基因的表达变化,结果表明,与野生型和单突变株相比,crc 和 hfq 双突 变株中苯甲酸代谢基因 benA、benR、benK 表达量显著下调。根据以上结果,推测 在 A1501 菌中,Hfq 和 Crc 在碳源代谢途径中发挥着协同作用。
2、采用原核表达体系表达纯化了 Crc 和 Hfq 蛋白,并通过微量热涌动实验
(MST)检测了 Crc 和 Hfq 蛋白与靶标分子 BenR(苯甲酸降解调控基因)的 mRNA
西南科技大学硕士研究生学位论文第
西南科技大学硕士研究生学位论文
第 II页
的体外互作。结果显示,Hfq 可与苯甲酸降解调控基因 benR 特异性结合。说明 Hfq
参与了以 Crc 为主要调控蛋白的碳代谢抑制途径。
3、 施氏假单胞菌A1501中hfq和crc基因的同时突变并不影响菌株在LB培养 基中的生长。在低氨、微好氧条件下的固氮酶活测定显示hfq和crc基因突变后施氏 假单胞菌A1501的固氮酶活明显下降。并且氮代谢调控基因(nifA、nifK、glnA、 glnK)表达量都发生下调。与此同时hfq和crc基因突变后使A1501丧失趋化能力, 说明Hfq和Crc在A1501的固氮过程中同时发挥重要的功能,从而影响其它代谢途 径。
综上所述,施氏假单胞菌 A1501 调控蛋白 Crc 与 Hfq 在碳代谢抑制调控中存 在协同作用,同时 Crc 与 Hfq 蛋白可能以某种未知的调控方式协同参与了该菌固 氮、逆境胁迫及运动等生理过程。本研究为施氏假单胞菌 A1501 的碳氮代谢调控 网络研究奠定了重要的理论基础。
关键词: 固氮施氏假单胞菌 A1501;Crc;Hfq;协同作用
西南科技大学硕士研究生学位论文第
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