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万方数据
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其中 70.5%(12/17)为 315 位密码子变异,且变异类型均为 AGC→ACC,敏感株
未发现 315 位点突变。11 株敏感菌和 4 株耐药菌在 katG463 位密码子发生变异, 变异类型均为 CGG→TGG,变异率分别为 78.6%(11/14)和 23.5%(4/17),敏感 菌和耐药菌变异率相比,χ2 值为 6.28,P>0.05,差异无显著性。有 12 株耐药株 的变异类型为 katG 基因双重位点突变,其中 10 株为 katG315(AGC→ACC)和 463(CGG→TGG) 位变异, 463(CGG→TGG) 和 299(GGC→AGC) 变异及
463(CGG→TGG)和 419(GAC→CAC)位变异各 1 株。2 株异烟肼耐药菌检出 oxyR-aphC 启动区 G32A 突变,其中 1 株为联合 katG463 和 299 位突变。 katG299,419 及 oxyR-aphC-G32A 位点变异在基因芯片检测法范围外。3、MIRU12 位点法将 86 株结核分枝杆菌分为 I,II,III,IV 四个基因群,75 个基因型,其 中 70 个独立基因型。I 群包含结核分枝杆菌 64 株,占全部菌株的 74.40%,为本 地的优势菌株。I 群中耐多药结核分枝杆菌 36 株,敏感菌株 28 株。4、除 70 株
独立基因型外的 16 株菌分型成 5 簇,最大簇包含 5 株菌,最小簇包含 2 株菌。 成簇率为 18.60%。5、12 个 MIRU 位点中,位点 26、31 显示高等程度多态性(h
>0.60),其中位点 26 显示多态性最高,h 为 0.704;位点 3l,10,39,16,40, 23,2 显示中等程度的多态性(h≥0.30);位点 4,20,27,24 显示较低多态性(h
<0.30);位点 24 只有一种等位基因型。6、经卡方检验,不同性别、年龄及基因 型别菌株耐多药率经 χ2 检验,χ2 值分别为 6.48,6.48,10.23,P 均大于 0.05。结 论:1、贵阳耐多药结核分枝杆菌利福平耐药基因突变主要的变异类型为 rpoB531 及 rpoB526 位点突变;2、贵阳耐多药结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变主要的 变异类型为 katG315 位点突变;3、贵阳耐多药结核分枝杆菌存在芯片(博奥生 物有限公司)法检测不涵盖的耐药基因突变;4、贵阳市结核分枝杆菌具有遗传 多样性,I 群为本地结核分枝杆菌主要流行菌群;5、MIRU26,MIRU31 在本地 区结核分枝杆菌中分辨力较好,MIRU4,MIRU27,MIRU20,MIRU24 分辨力 较差;6、性别、年龄、基因型别均与本地区结核分枝杆菌耐多药性无关。
【关键词】结核分枝杆菌;耐多药结核分枝杆菌;基因分型;串联重复序列
The reaserch of mutation characteristics and VNTR genotyping
III
of MDR Mycobacterium tuberculosis strains isolated from patients in Guiyang area
Major: Pathogen biology Postgraduate: BI Ya-kun Supervisor: Chen Zheng-hong
[Abstract] Objective: The purpose of this study is to analyze gene mutations related with isoniazid and rifampicin resistance of Mycobacterium tuberculosis(MTB) in Guiyang area and to investigate the genotype distribution of Mycobacterium
tuberculosis clinical isolates from Guiyang area with the multiple locus variable number tandem repeats analysis. Methods: 1. MTB strains were isolated by Lowenstein-Jensen method. Drug sensitivity of MTB isolates was detected by
conventional ratio method. 2.The rpoB,katG, inhA, oxyR-aphC gene fragments of
Mycobacterium tuber
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