基于CHD基因序列分析的帝企鹅性别鉴定研究.doc

基于 CHD 基因序列分析的帝企鹅性别鉴定研究沈 玮 ,潘少坤 ,罗红梅 ,刘 基于 CHD 基因序列分析的帝企鹅性别鉴定研究 沈 玮 ,潘少坤 ,罗红梅 ,刘 伟 ,朱 标 ,曹祥荣 3 (南京师范大学生命科学学院 ,江苏南京 210046 ) 摘要 [目的 ]分析帝企鹅 (A ptenody tes forsteri) CHD 基因序列 ,以鉴定性别 。 [方法 ]采用苯酚 ∶氯仿抽提法提取 6只未知性别的帝企鹅血 液中的基因组 DNA ,运用 P2 / P8引物扩增 CHD 基因片段 ,将 PCR 产物克隆到 T2V ector,利用 NCB I的 B last程序 ,以短趾鹰 ( C ircaetus ga l2 licus)同源序列为比对参照 ,将帝企鹅 CHD 基因片段序列与 GenB ank 中的基因片段序列进行同源性比较分析 ,鉴定帝企鹅的性别 。 [结 果 ]测序结果表明 , CHD 2Z和 CHD 2W 基因的 PCR 产物大小分别为 378、387 bp ,雌雄结果并不明显 ,不易区分开来 。B la st比对结果表明 , 帝企鹅 LD、EK、ZF为雄性 ,帝企鹅 D G、YA、YY为雌性 。 [结论 ]结合 PCR 扩增和测序分析 CHD 基因 ,是单态性鸟类性别鉴定的有效和 准确的方法 。 关键词 帝企鹅 ; CHD 基因 ;测序 ;性别鉴定 中图分类号 S 835 文献标识码 A 文章编号 0517 - 6611 ( 2010) 03 - 01167 - 02 Study on Sex Iden t if ica t ion of Em peror Pen gu in ( A p ten odytes fo rs te r i) Ba sed on Sequen ce Ana lysis of the CHD Gen e SHEN W e i e t a l ( Co llege of L ife Sc ience s, N anjing No rm a l U n ive rsity, N an jing, J iangsu 210046 ) A b stra c t [ O bjec tive ] The re sea rch a im ed to ana lyze the CHD gene sequence of Emp e ro r Pengu in (A ptenody tes forsteri) to iden tify its sex. [M e thod ] The gene tic DNA wa s extrac ted from the b lood of 6 A. forsteri wh ich sex wa s unknown. The PCR amp lified fragm en ts w ith p rim e rs P2 / P8 we re c loned in T2V ec to r. Tak ing homo logous sequence of C ircaetus ga llicus a s refe rence, the CHD gene sequence wa s compa red to the homo logue s in GenB ank to identify its sex. [ R e su lt ] The sequenc ing re su lts showed tha t the PCR p roduc ts of CHD - Z and CHD - W we re 378、387 bp re sp ec tive ly, and sex cha rac te r wa s no t significan t fo r d ivid ing sex. The B la st comp a ra tive re su lts showed tha t A. forsteri LD , EK and ZF wa s m a le, and A. forsteri D G, YA and YY wa s fem a le. [ Conc lu sion ] The m e thod of com b in ing PCR amp lifica tion and sequenc ing to ana lyze the CHD gene is an accu ra te and re liab le way to de te rm ine sex of monomo rp hic avian. Key word s Emp e ro r Pengu in (