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WB注意事项及常见问题
注意事项
样本收集
组织样本
原则上要求客户或我们的技术员把组织分切剪碎至研磨管(根据实验的需要告知他们取多少组织),并加入适量裂解液和研磨珠,然后放置于-80℃保存。具体详情参照“组织样本收集注意事项.doc”;
细胞样品
原则上要求客户或我们的技术员不要用胰酶把细胞消化下来,特别是分选对象是膜蛋白时,具体详情参照“细胞样品收集注意事项.doc”;
总蛋白提取
组织样品
具体详情参照“组织样本收集注意事项.doc”;记得加入蛋白酶抑制剂,如果分选对象是磷酸化蛋白时,记得加入磷酸化酶抑制剂;
细胞样品
具体详情参照“细胞样品收集注意事项.doc”;记得加入蛋白酶抑制剂,如果分选对象是磷酸化蛋白时,记得加入磷酸化酶抑制剂;
蛋白样本保存
裂解细胞或组织提取总蛋白时,细胞碎片沉淀一般-20℃保存以防万一,提取好的蛋白样品分装2份,一份加入上样缓冲液变性后-20℃保存,一份直接-20℃保存;
蛋白变性
提取好的总蛋白取一部分(不是全部)加入上样缓冲液进行加热变性(100℃,5min),变性好的蛋白应该-20℃保存,冻融后不再需要加热变性;
SDS
浓缩胶的胶浓度一般为5%,用于压沉样品;
分离胶的胶浓度取决于分析对象的分子量大小,详情见Western Blotting 全攻略.pdf第4页;
分离胶和浓缩胶的高度比为8:3;
电泳结束后,应及时用清洗干净玻璃板,清洗时应使用海绵擦布,切勿使用刷子,以免刮花玻璃板;
电泳结束后,应及时冲洗电泳槽,以免盐离子沉积,导致电泳丝腐蚀;
清洗电泳芯时,一定要注意别弄段电泳丝;
转膜
注意海绵垫,滤纸(转膜专用滤纸),转印膜,胶的叠放位置,以保证正确的转印方向;
注意海绵垫,滤纸(转膜专用滤纸),转印膜,胶的相对大小,以免造成短路;
转印结束后,应及时取出转印膜,并立即用TBST漂洗1-2遍,并立即加入封闭液,这样可以避免膜上的杂质残留或膜变干导致背景高的问题;
转印结束后,应及时冲洗转印槽和转印芯,以免盐离子沉积,导致电泳丝腐蚀;
转印结束后,应及时用水泡洗海绵垫和滤纸,以免盐离子沉积,导致转膜时短路,并放在篮子上晾干,如果海绵垫和滤纸不及时晾干,容易导致海绵垫和滤纸内部的结构破坏;
封闭
1. 进行封闭时,应加入足量的封闭液(以完全覆盖膜为底限),并保证整个封闭过程中,膜与封闭液充分接触,避免长时间离开封闭液,特别进行4℃静止封闭过夜时,一定要加入足量的封闭液和保证平坦放置;上述注意事项主要为了避免膜变干,导致背景升高;
一抗杂交
一抗的稀释比例:第一次使用时参考具体抗体说明书建议的稀释比例,并根据实际的实验结果进行调整;
杂交条件:如果是室温孵育,至少保证孵育1-2小时,并放置脱色摇床上进行摇晃,如果是4℃孵育,应孵育过夜,可静止亦可放置脱色摇床上进行摇晃;
应使用专用的一抗稀释液进行稀释,使用后进行回收并4℃保存,如果回收的稀释抗体用沉淀或长菌,应丢弃;
一抗杂交后洗膜
一般使用标准的TBST缓冲液,如果判断因为是一抗的原因导致的背景过高,可以把NaCl的浓度提高到500 nM (标准的为150nM);
一般洗涤3次,每次10min,如果判断因为是一抗的原因导致的背景过高,可以把洗涤次数提高到4-6次;
二抗杂交
1. 二抗的稀释比例:第一次使用时参考具体抗体说明书建议的稀释比例,并根据实际的实验结果进行调整;
2. 杂交条件:一般室温孵育,孵育1小时即可(时间延长会产生非特异杂交,从而导致背景过高),并放置脱色摇床上进行摇晃(一定要避免膜变干,否则背景其高);
3. 应使用封闭液进行稀释,使用后进行不回收;
二抗杂交后洗膜
1. 一般使用标准的TBST缓冲液,如果判断因为是一抗的原因导致的背景过高,可以把NaCl的浓度提高到500 nM (标准的为150nM);
2. 一般洗涤3次,每次10min,如果判断因为是一抗的原因导致的背景过高,可以把洗涤次数提高到4-6次;
拍照
1. 注意选择曝光时间,同时兼顾工作效率,因选择连续拍照模式,这样总有一个何时曝光时间;
报告单整理
原始图片;
对比度和亮度调整的图片;
图片说明:上样顺序;
灰度值:原始值,数据标准化(同一个样品的目标蛋白的灰度值除以内参蛋白的灰度值),相对表达量(实验样品的数据标准化比值除以参照样品(问客户)的数据标准化比值),参照样品的相对表达量一定为1;
实验方法:准确的一抗,二抗,稀释比例;
常见问题
没信号
膜一片空白,没有任何条带,阳性对照样品也无条带:实验失败?抗体失效?;重新进行实验,重新稀释抗体;
膜一片空白,没有任何条带,阳性对照样品有条带:实验样品降解?实验样品无该蛋白的表达?转膜效率过低?;重新进行实验,复核查找上述原因,以寻找对策;
背景过高
目的条带以外的区域有信号,如果是片
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