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第三章 药物分子设计的基本原理和方法 设计和发现新药,寻找高效、低毒的新化学实体(NCE) 药物分子设计是新药研发的开端和基础。 人类已经成功研发许多药物,积累了一定的经验和理论。近年的分子生物学和计算机技术的发展,为从分子水平上进行药物设计奠定了基础,不断丰富和发展设计方法。 药物分子设计是通过研究分子(药物小分子和靶点生物大分子)的二维和三维结构,寻找具有药理活性的新化学实体。 药物设计的2个阶段:先导物的发现,先导物的优化。 作用靶点:受体、酶、离子通道及核酸。 借助分子生物学和计算机技术进行 靶点导向的药物设计。 第一节:先导化合物的发现及优化方法 先导化合物的获得、结构优化、药效试验和构效关系研究 一 先导化合物的获得 1 从天然产物(植物、动物、微生物)中获得 (1)从植物中获得 可可树叶中提取的活性成分可卡因---普鲁卡因---利多卡因;鸦片吗啡---左啡诺---喷他佐辛;青蒿素、紫杉醇、丁苯酞。 (2) 从动物中获得 从南美的一种毒蛇的毒液中提取的活性成分替罗普肽---卡托普利。 (3)从微生物的代谢物中获得 四大素的发现、降血脂药洛伐他汀等。 2 从内源性物质获得 肾上腺素—β受体阻滞(拮抗)剂普萘洛尔(降压药)、β1受体激动剂沙丁醇胺(治疗哮喘)。 组胺—H1受体拮抗剂扑尔敏、息斯敏(抗过敏药)、H2受体拮抗剂西咪替丁、雷尼替丁(治疗胃酸分泌过多) 3 从合成的化合物中发现先导化合物 (1)磺胺药物的发现 染料白浪多息—磺胺类抗菌药、降糖药。 (2)合成的中间体 抗结核药--异烟肼,抗癌药安西他宾。 (3)化合物库(制药公司的化合物库,筛选 对新靶点的作用) (4)组合化学与高通量筛选 (5)计算机分子模拟、虚拟筛选。 4 从临床副作用发现先导化合物 由抗结核药异烟肼(服用者兴奋)--异丙烟肼(MAOI,治疗抑郁症)。 抗过敏药异丙嗪(具有外周神经作用)--氯丙嗪(强效安定药)--丙咪嗪(三环类抗抑郁药,5-HT重摄取抑制剂) 5 从药物代谢产物中发现先导化合物 镇静安眠药地西泮—代谢物奥沙西泮—劳拉西泮、替马西泮。抗抑郁药丙咪嗪—地西帕明 二 先导化合物的优化方法 1 分子中环的改造—开环 可卡因—普鲁卡因。吗啡—左啡诺—非那左辛、喷他佐辛。阿托品—哌替啶(杜冷丁)--美沙酮 2 环的引入--增加分子的刚性,提高选择性作用,减少副作用。 诺氟沙星—左氟沙星 β受体阻滞剂(降压药)--色满卡林(钾离子通道开放剂,降压药) 3 分子中链状部分的改造 将药物分子中的碳链增长或缩短,可以改变活性,甚至改变活性类型 胡椒碱(抗癫痫)--桂皮酰胺化合物(增强了抗癫痫活性,减少了合成的难度。 去甲肾上腺素,R基团改变,活性发生变化。 4 电子等排体置换 (1)经典电子等排体、生物电子等排体概念 经典电子等排体:a)具有相同的电子数目和相同的电子排列的化合物或基团;它们具有相似的物理性质。如:CO,N2;CO2,N2O。b)H置换规则; 如:CH,N; CH2,O; CH3,F; NH,O; NH2,F; OH,F。C)最外层电子数目相同的原子或基团;如:N,P,As;O,S,Se;Cl,CN;-CH=CH-,-S-。都互称电子等排体。 生物电子等排体:大小、形状、电荷密度相似,产生相同或相反的生物活性的基团或结构片段,均称之为生物电子等排体。 羧基、四氮唑基;磺酸基、磺胺基;苯、吡啶、噻吩、呋喃。 (2)电子等排体的应用 例1:降糖药氨磺丁脲和甲磺丁脲。 例2:抗过敏药曲吡那敏、氯苯那敏 例3:尿嘧啶、5-氟尿嘧啶 例4:强心药硫马唑、伊索马唑 5 拼合原理 治疗效果相同的药物拼合在一起。 例1:阿司匹林+扑热息痛=贝诺酯 例2:肼基哒嗪+β受体阻滞剂=普齐地洛 例3:氨苄西林+舒巴坦 第二节 药物的潜伏化—前药及生物前体 将具有活性的物质(原药)转变成体外无活性或低活性的化合物,进入体内后,经酶促反应或化学作用,转变成原药,发挥药理作用;称之为药物的潜伏化。具有2种方式:前药和生物前体。 与原药相比,前药或生物前体应具有更优良的理化性质或药代动力学性质。 一 前药和生物前体的概念 前药:将原药以共价键的方式,与特定的基团或片段连接,得到的修饰物;在体外无活性;进入体内后,经过酶催化的水解反应,释放出原药。 生物前体:体外无活性的化学物质,进入体内后,经过酶催化发生氧化、还原或其他反应,转化成具有生物活性的药物。 二 设计前药的方法 1 原药分子中具有-OH、或-COOH,可以转化成

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