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液体活检专家共识.pptVIP

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液体活检的专家共识 军事医学科学院附属医院 秦海峰 Content Content 原癌基因 (proto-oncogene) 癌基因活化(oncogene) 基因变异类别 抑癌基因 (tumor suppressor gene, TSG) 功能缺失 活化 失活 基因突变 扩增或缺失 易位融合 表观遗传修饰 … 其他基因 Modifying gene 调节功能异常 表达异常 分子标志物种类及其对应的检测方法 Bio-specimen variation DNA: mutation, translocation, CNV, MSI Deletion RNA: Single gene expression Gene expression profile Protein Single protein Protein profiling Epigenetic: Methylation pattern … Technology DNA Sequencing, RT-PCR qPCR, aCGH FISH, CISH RNA qRT-PCR Microarray techniques TaqMan® gene expression array Protein IHC, ELISA, mass spectrometry Epigenetic MS-PCR, bisulphate-PCR-sequencing Methylation micorarray NGS 目前NGS检测变异类型:SNV, Indels, Rearrangement/fusion, CNV及少数表观变异 《二代测序(NGS)技术应用于临床肿瘤精准医学诊断的共识》 (第一版2016.04.23) 中国肿瘤驱动基因分析联盟(CAGC) 中国临床肿瘤学会(CSCO) 国内共识推荐NGS用于临床检测 “首先我们非常清楚液体活检和NGS的哪些部分可以应用到临床,如小的PANEL可用于现在市场上CFDA已经批准的药物的检测,这些可以应用到临床”。 ——2016年3月5日第十三届中国肺癌高峰论坛吴一龙 共识:……检测已知的、多个平行临床可药物抑制的靶点,液体活检技术推荐NGS方法 共识:用于发现未知基因,探索疗效监测、预后判断和发现耐药机制等,液体活检技术建议使用NGS方法。 ——2016年3月5日第十三届中国肺癌高峰论坛 共识中包括的9个内容、36项声明 Content 西方: 2013 ASCO 东方: 370例中国肺腺癌 肺癌中已发现的驱动基因及频率 关注de novo Unkown!!! 关注耐药后的变异 !! ! 肺癌中已发现的驱动基因及频率 原发灶和转移灶的基因突变异质性(空间分布差异性) 同一瘤灶内基因突变异质性 治疗前后基因突变异质性——时间分布差异性 肺癌瘤内异质性实例 肿瘤细胞之间存在较强的分子异质性 Cancer Genome Landscapes. Science (New York, NY). 2013;339(6127):1546-1558. Content A Single Dominant Mechanism of Acquired Resistance to Rociletinib is not Readily Identifiable Presented By Lecia Sequist at 2015 ASCO Annual Meeting 耐药机制的精准分析 15 AZD9291 treated pts 6 cases of C797S mutations (40%) Oxnard, et al. Nat med, 2015 耐药机制的精准分析 耐药机制的精准分析 Acquired resistance to Rociletinib 12 Pts with 13 T790M+ samples: 7 samples retained T790M (3 EGFR amp); 6 samples loss of T790M ( 2 conversion to SCLC) 2015 ASCO, 20 cases: FGFR3 mut; MET amp … Acquired resistance to AZD 9291 15 plasma DNA samples from 15 pts 6/15 C797S + E19 del + T790M 5/15 E19 del + T790M 4/15 E19 del HER2 amp BRAF mut NRA

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