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国家重点基础发展规划项目
课题结题总结报告
项目编号:G1998010200
项目名称:农作物资源核心种质构建、重要新基因发掘与有效利用研究
首席科学家:贾继增 张启发
课题编号:G1998010207
课题名称:水稻抗病基因克隆
课题负责人:翟文学
子课题负责人:翟文学 彭开蔓(王石平)
承 担 单 位:中国科学院遗传所,华中农业大学
电子信箱:wxzhai@genetics.ac.cn,
HYPERLINK mailto:swang@mail.hzau.edu.cn swang@mail.hzau.edu.cn
200
一、计划任务完成情况
本课题的预期目标是分离克隆2个水稻抗病基因。我们已经按计划开展了研究工作,分别对水稻抗白叶枯病基因Xa3、Xa4、xa5、xa13、Xa25(t)和Xa26以及抗稻瘟病相关基因进行了克隆研究。目前已克隆并证实了Xa26基因;已克隆Xa4和xa5基因,即将证实其功能;精细定位了Xa3、xa13和Xa25(t)基因;获得了3个抗稻瘟病相关基因。基本达到预期研究目标。
具体工作与取得的进展如下:
1. 精细定位了水稻抗白叶枯病基因Xa4和Xa26
我们利用F2大群体,分别对水稻抗白叶枯病基因Xa4和Xa26进行了遗传分析和精细遗传定位。这两个基因都位于第11号染色体的长臂末端并紧密连锁。涉及Xa4基因(Sun et al., 2003, Theor. Appl. Genet. 106:683-687)和Xa26基因(Yang et al., 2003, Theor. Appl. Genet. 106:1467-1472)遗传分析的工作已发表。
2. 分离克隆了水稻抗白叶枯病基因Xa26
我们采用图位克隆法从水稻品种明恢63中分离克隆了Xa26基因(专利申请号9)。序列分析发现这该基因编码LRR受体激酶类蛋白质。研究还发现,无论是在苗期还是成株期携带Xa26基因的转基因水稻的抗谱比Xa26基因的供体水稻品种(明恢63)的抗谱显著增宽,抗性明显增强,说明遗传背景可能影响抗病主效基因的作用。分离克隆Xa26基因的工作正在发表印刷之中(Sun et al., 2003, Plant J., in press)。另外,研究还发现携带抗白叶枯病基因Xa3的近等基因系IRBB3和携带抗白叶枯病基因Xa22(t)的云南地方稻品种扎昌龙也携带Xa26基因。因为Xa3和Xa22(t)基因也被他人定位于第11号染色体长臂末端,推测Xa26、Xa3和Xa22(t)是同一个基因,这部分验证工作正在进行之中。
3. 分离克隆了水稻抗白叶枯病基因Xa4
我们采用图位克隆法从水稻近等基因系IRBB4中分离克隆了Xa4基因(专利申请号9)。序列分析发现这该基因也编码LRR受体激酶类蛋白质。Xa4和Xa26属于同一个基因家族的不同成员。抗性分析发现发现籼稻品种特青和93-11与IRBB4的抗谱相同,序列分析发现特青和93-11也携带Xa4基因。转基因初步实验结果显示遗传背景可能也影响Xa4基因的抗性。目前,这部分工作正在完善之中。
4. 分析了Xa4和Xa26所属基因家族的进化
Xa4和Xa26基因所属家族(命名:Xa26基因家族)包括10个成员。我们对水稻品种明恢63和特青包含Xa26基因家族的大约100 kb区段进行了测序,对比公共数据库中的水稻品种日本晴和93-11的同源区段的序列,分析了抗病基因的进化模式。涉及这部分工作的论文正在撰写之中。
5. 鉴定并精细定位了一个水稻抗白叶枯病新基因Xa25(t)
在杂交水稻恢复系明恢63中鉴定了一个新的抗白叶枯病显性基因Xa25(t)。该基因在苗期和成株期都能特异性的抗白叶枯病菌生理小种PXO339。通过分析携带Xa25(t)基因的重组自交系群体,将该基因定位于水稻第12号染色体的着丝粒区。在该着丝粒区段已经定位了多个水稻抗稻瘟病基因,推测Xa25(t)基因与抗稻瘟病基因紧密连锁或等位。涉及Xa25(t)基因的研究工作已发表(Chen et al., 2002, Phytopathology 92:750-754)。
6. 构建了水稻全生育期平衡化cDNA文库
利用水稻品种明恢63,构建了全生育期平衡化cDNA文库。该文库由水稻不同生长时期和不同生理状态下的15种不同组织的cDNA组成,包括白叶枯病菌和稻瘟病菌接种诱导后的组织。该文库包含大约62,000个克隆,平均插入片段为1.4 kb (Chu et al., 2003, Chinese Science Bulletin 48:229-235)。对该文库中的大约4万个cDNA克隆进行了测序, 获得两万多个非重复EST
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