微生物分类和鉴定讲解学习.ppt

第十章 微生物的分类和鉴定; 分类是认识客观事物的一种基本方法。 要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。 分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类、鉴定、名(分类学的具体任务);一、分类单元及其等级;常用的微生物分类学术语：;3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等;高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准. 微生物的种：一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有明显差异的菌株群。;5）亚种（subspecies）：是进一步细分种时所用的概念。指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。 6）新种（species nova）：指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。 7）模式菌株（type strain）：一个微生物种的具体的活培养物，是由一个被指定为命名的模式菌株传代而来，理应与原初的描述完全一致的纯培养物。;双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，一般用斜体表示 属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示. 例如 Bacillus sp;由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”;三、常用微生物分类鉴定的方法;（一）形态学特征;（二）生理生化特征;（三）核酸的碱基组成和分子杂交;1、DNA的碱基组成(G+Cmol%);1）每个生物种都有特定的GC%范围，因此后者 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围 为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细 菌的分类鉴定。;2）GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，并可检验表型特征分类的合理性， 从分子水平上判断物种的亲缘关系。;同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下； 同属不同种的差别应低于10～15%； G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基本特征，它对于种、属甚至科的分类鉴定有重要意义。;80年代以前螺菌属(Spirillum)不同种的G+C含量范围宽达38～66%，后来“伯杰氏手册”(1984)结合其他特征已将其分成三个属：;过去根据形态学特征曾认为微球菌属(Micrococcus)和葡萄球菌属(Staphylococcus)是关系很近的两个属，因而长期放在一个科内，由于G+C含量的差异(分别为30～38%和64～75%)表明它们亲缘关系相当远，现在根据16SrRNA序列资料已进行新的调整。;在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，G+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。;2、核酸的分子杂交;3．电子杂交;四、 伯杰氏手册;从20世纪80年代末期，该手册改名为： 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)