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·34 · 试验研究 2009 ( 34 ) 5
广东畜牧兽医科技 年 第 卷 第 期
新型鸭肝炎病毒 株全基因组序列分析
FS
1 2 1 1 1*
何冉娅 ,孙 伟 ,罗玉均 ,何逸民 ,张桂红
(1.华南农业大学兽医学院,广东 广州 510642;2.西南大学药学院,重庆 400715)
摘 要: 本试验参考GenBank 中已公布的新型鸭肝炎病毒全基因组序列,应用Pr i mer Pr emi er 5. 0
7 RT- PCR
软件,在序列保守区域分别设计了 对引物,通过 方法对本实验室已鉴别纯化的新型鸭肝炎病
FS FS GenBank
毒 株进行了分段扩增,经过测序拼接整理,获得 株全基因组序列( 中登录号为
EU877916 FS 7792 2251aa
)。序列分析表明, 株全长 个碱基,一个大的开放阅读框编码 。将各基因与国
G GenBank
内外已发表的新型鸭肝炎病毒参考毒株进行相似性分析,结果表明,与 株( 登录号为
EU755009 99. 2% FS G C- GY GenBank EU352805
)核苷酸相似性最高,为 ,而 株与 株和 株( 登录号为 )的
99. 6% DHV- HS DHV- HSS 83. 6%
氨基酸相似性最高,均为 ,与 株和 株的相似性最低,均为 。系统发育树分
G
析发现,与 株亲缘关系最近。
关键词:新型鸭肝炎病毒;全基因组;序列分析
中图分类号: S858.32 文献标识码: A 文章编号: 1005-8567(2009)05-0034-05
Complete genome sequence analysis of strain FS, a new serotype of duck
hepatitis virus
1 2 1 1 1
He Ranya , Sun Wei , Luo Yujun , He Yimin , Zhang Guihong
(1.College of Veterinary Medicine, South
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