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RNA转录后的加工;第八章 RNA转录后的剪接与加工;一、RNA转录后的剪接、加工与修饰概述
二、原核生物RNA的转录后加工
三、真核生物RNA 的转录后加工;RNA的类型和功能;一、RNA转录后的剪接、加工与修饰概述
二、原核生物RNA的转录后加工
三、真核生物RNA 的转录后加工;在翻译过程中参与蛋白质合成的tRNA和rRNA都不是最初的转录产物,这是由于:
①它们的5′端都是单磷酸,而原始的转录产物5′端应是三磷酸
②分子比初始转录物小;
③tRNA含有特殊的碱基,这些碱基只有通过一些化学修饰才可
以产生。
;(一)原核生物rRNA前体的加工;①;(二)原核生物tRNA前体的加工
E.coli基因组有tRNA基因约60个
tRNA基因大多成簇存在(串联的tRNA可能相同,也可能不 同),或与rRNA基因或蛋白质基因组成混合转录单位.
单顺反子(不常见);到目前为止了解的最清楚的是E.coli的tRNA1Tyr(连续两个组成一个多顺反子RNA);RNaseP 是一种核酶 (Ribozyme);;3‘ 端加上CCA
在细菌中有两种tRNA前体,其区别在于其3端的序列。
;碱基修饰: 甲基化酶、硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等等;(三)原核生物mRNA前体的加工;类似的加工过程也可以在某些噬菌体的多顺反子mRNA中见到。例如,大肠杆菌噬菌体T7的早期基因转录出一条长的多顺反子mRNA,经RNaseIII切割成5个单独的mRNA和一段5′端前导序列。mRNA的切割对其中某些早期蛋白质的合成是必要的。推测可能是由于较长的mRNA产生二级结构,会阻止有关编码序列的翻译。这种RNA二级结构(可能还有三级结构)与其功能的调控关系在多种情况下均可看到,并不仅限于翻译起始的调控。通过RNA链的裂解,改变了RNA的二级结构,从而影响它的功能。
;一、RNA转录后的剪接、加工与修饰概述
二、原核生物RNA的转录后加工
三、真核生物RNA 的转录后加工;(一)真核生物rRNA的加工;真核生物rRNA的加工过程比较缓慢,中间产物可以分离,因此加工过程比较清楚。
哺乳动物45S RNA的加工有几种不同方式。例如,人类45S RNA与小鼠的45S RNA加工方式就不相同。
RNaseIII和其他RNA酶在前体加工中发挥重要作用;rRNA前体剪切位点的识别:
核仁小分子RNA(snoRNA)形成的snoRNP???与RNase 对特定立体结构和剪切位点的识别, 也参与甲基化修饰位点的识别
RNA前体分子的甲基化帮助识别
;5S rRNA的基因含120bp,处在另一个转录单位中,这个单位含有120bp的转录区和600bp的非转录片段
5S rRNA由RNA聚合酶Ⅲ转录。;(二)真核生物tRNA的加工;tRNA的加工分成3个阶段:
5’剪裁,3’剪裁
切除内含子
3′末端用tRNA核酸转移酶加-CCA
修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等进行修饰;4-硫尿苷;真核tRNA内含子的特点:;2’,3’环磷酸;1.5’端加帽
2.3’端加尾
3.RNA的剪接
4.修饰
5.RNA的编辑;1、在5’端加帽(cap));剪接前加帽,剪接后加帽;剪接前加帽:(含有最初的5‘端三个磷酸,转录第一个通常是A或G);剪切后加帽;帽子结构功能:
有帽子结合蛋白(CBP)与帽子结合:
(1)有助于mRNA运输越过核膜,进入胞质;
(2)保护5′不被酶降解;
(3)翻译时供eIF(起始因子)和核糖体识别。
(4)促进5’端内含子的剪切;或称为RNA末端腺苷酸转移酶,Poly(A)聚合酶;具体机制;多聚腺苷酸尾巴功能:
有蛋白质(PBP)与PolyA尾结合,提高了mRNA在细胞质中的稳定性。
增强翻译的效率;4. 修饰;3、RNA的剪接;生物体内内含子的主要类型:
第一类:自我剪接内含子,不需要酶和蛋白质的参与。
Ⅰ型:真核生物线粒体、四膜虫、 一些叶绿体和噬菌体的RNA
Ⅱ型:主要在线粒体和叶绿体基因
第二类:酶促拼接,在一系列酶(蛋白性质,非核酶,非snRNP)的催化下完成(无转酯反应),主要在tRNA前体中发现。
第三类:依赖于snRNP (剪接体)的剪接。绝大多数真核生物蛋白质基因。;第一类—Ⅰ型内含子的自我剪接;I类内含子的剪切机制;L-19 IVS
functions as
a real catalyst
in the test tube;L19 RNA催化的反应;I类内含子的结构特点是; 在线粒体基因组中发现,也存在于极少数单细胞真核生物(如嗜热四膜虫的rRNA)的核基因组中。
原核体系中少数内含子也是Ⅰ型内含子(如T4噬菌体胸苷酸合成酶基因)。 ;第一类—Ⅱ型内含子的自我剪
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