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三链DNA的生物学功能 (1)控制基因转录:通过引入寡核苷酸形成三链,作用于转录子、增强子和启动子区,增强或抑制基因的转录,是在转录水平调节基因表达的有效手段。可用于治疗癌症、艾滋病、病毒性感染等。 (2)保护靶序列防止酶切:某些位点形成三链可防止被酶切割,这种保护作用是可逆的。 (3)充当分子剪刀:形成第三链的寡聚脱氧核苷酸,可充当切割靶序列的分子剪刀,在寡聚脱氧核苷酸的末端连接一化学试剂,通过氧化等作用可使双链断裂产生特意性片断,比限制性内切酶识别位点长,具有更高的精确性与专一性。 4、DNA的四链结构 染色体端粒DNA的末端,一般由5~8bp的短核苷酸重复构成,这种序列中富含鸟嘌呤残基,通过X-射线衍射分析与核磁共振研究,存在(T/A)mGn(m=1~4,n=1~8)序列的单链DNA,可以形成分子内或分子间的四螺旋结构。由于端粒的这种结构由G之间的氢键构成,故称G-四联体螺旋(G-quadruplex)。 G-四联体螺旋的基本单元是G-四联体(G-quarter),由四个鸟嘌呤通过Hoogsteen氢键在一正方形平面内连接而成,每一个G都可作为氢键的供体和受体。在四联体的中心存在由4个带负电的羰基氧原子围成的“口袋”,是配位结合阳离子相互作用的位点。连续的G-四联体的堆积,通过折叠可形成分子内四联体螺旋、双分子间四联体螺旋、四分子间四联体螺旋甚至更高级的结构。 G-四联体螺旋DNA在热力学和动力学上都很稳定,这是与配位离子的类型有关,与“口袋”内径相匹配的离子才能较好的与其相互作用。单价离子的稳定作用依次为K+>Na+>Cs+>Li+。 5、DNA的三级结构 包括单链形成分子内的多种螺旋和环状结构,环状分子的打结,超螺旋和连环体等拓扑构型,线性双链可能存在的弯曲和超螺旋。 DNA的线性序列负载遗传信息,而紧缩的超螺旋结构存储着生物学过程必需的能量和信息,是一种重要的功能态,对复制、转录、重组等重要生物学过程的研究,都需要对超螺旋DNA了解,才能进而更多地揭示这些过程的本质。如超螺旋产生的局部张力,可以影响双链DNA的结构,形成Z-DNA、发夹结构、十字状等构象,使正常细胞中的DNA回文结构从规则的螺旋中显现出来,成为一个识别信号。 DNA的超螺旋结构是DNA三级中最常见的形态。正常的DNA双螺旋由于解旋或增旋产生的张力,促使DNA内部的原子位置重新排列,导致DNA分子本身发生卷曲而称为超螺旋(superhelix)。由解旋形成的超螺旋为右手超螺旋,又称负超螺旋;由增旋形成的超螺旋为左手超螺旋,又称正超螺旋。 DNA超螺旋一般由2种形式,一是双链闭环DNA形成的相互盘绕式超螺旋,此种DNA较小,大都存在于质粒、线粒体、叶绿体和某些病毒中;二是螺旋管式超螺旋,存在于真核细胞染色质中,在染色质中DNA环绕组蛋白形成核小体。 四、核酸的结构与功能 核酸(nucleic acid)的发现及研究历史是生命科学最令人激动和兴奋的成就。 核酸的种类及其成分 种类:RNA(ribonucleic acid)、DNA(deoxy ribonucleic acid )。 成分:碱基(base)、戊糖(pentose)、核苷(nucleoside)、核苷酸(nucleotide) 表示方法、书写、阅读方向 nucleic acid nucleotide nucleoside phosphate purine base base ribose amyl sugar deoxyribose pyrimidine base β-D-核糖 β-D-2-脱氧核糖 分子生物学发展史上的重大事件 (一)DNA的结构 1、DNA的一级结构及序列测定 DNA的一级结构储存着生物的遗传信息,是结构基因组的基础。 DNA是十分巨大的生物高分子。一般地,每个细胞中DNA的碱基对随着生物进化水平的上升而相应增加。若以长度表示DNA分子大小,则1μm=2×106(相对分子质量);若以碱基对表示DNA分子大小,则1bp=6.3×102(相对分子质量)。天然DNA分子小的长几千碱基对,大的则几十亿个碱基对。 DNA的核苷酸序列测定 1965年,Robert W.Holley运用“片断重叠法”(RNase A和RNase T1 )首次研究了酵母丙氨酸tRNA(77nt)的一级结构。 物理图谱 DNA的化学法测序 1977年Maxam 和Gilbert利用硫酸二甲酯和肼着两种试剂特异修饰碱基,然后用哌啶切断反应碱基的多核苷酸链,产生一套长短不等的片断后分析比较。 化学裂解法测定DNA的核苷酸序列 DNA的酶法测序 (1)加减法:1975年Frederick Sanger利用特异DNA聚合酶测定了噬菌体φX17
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