利用NCBI Map Viewer在染色体图谱上查找基因.pdf

维普资讯 中华医学遗传学杂志2005年 4月第 22卷第 2期 ChinjMedGenet，April2005，Vo1．22，No．2 · 235 · · 经 验 交 流 · 利用NCBIMapViewer在染色体图谱上查找基因 顾萍 李健康 NCBIMapViewer是一种能从众多资源中汇集图谱和序 因组的第 34次数据装配。Build34是以2004年 2月 10日的序 列信息的网络资源。它既允许用户浏览和检索某有机体完整基 列数据为基础而建立的。 因组信息 ，又允许用户在序列水平，通过浏览单个染色体图谱 在Homosapiensgenomeview页面，用户若查找图谱上的 或某染色体上的特定 区域，探查 完整基因组信息。由于Map 任何信息，如基因符号、基因库登录号 、标记物名称或疾病名称 Viewer能提供的与不同有机体相对应的图谱种类有很多，如 等，只需在 Searchfor提 问框中输入相应的检索词，点 “Find”即 脊椎动物 (Vertebrates)、无脊椎动物 (Invertebrates)、哺乳动物 可 。 (Mammals)、植 物 (Plants)、真 菌 (Fungi)及 原 生 动 物 例如，输人人遗传性血色病 (hereditaryhemochromatosis) (Protozoa)等，我们以哺乳动物中的人染色体图谱为例 ，交流如 基因符号 “HFE”，点 “Find”后 ，系统会返回2条记录。在染色体 何在染色体图谱上查找特定的基因。 栏 onchromosome(s)空出的情况下，系统进行的是基于文本的 检索。 1 查询染色体 图谱 检索结果的页面上方显示了所有人类染色体图形 ，并用指 进人 NCBIMapViewer主页 http：／／www．ncbi．nlm．nih． 针指出HFE在第 6号染色体短臂上的位置 ；页面的下方则表 gov／mapview／static／Mvstart．html，从 Search提 问框下拉式菜 明 了HFE可 通 过两 种不 同的 图谱 描 述：Genes cyto和 单中选择 Homosapiens(humans)，点 “Go”按钮，或在主页面 Genes seq。点 “Mapelement”栏相应的选项 (本例为HFE)，能 — 结构树 中直接点击Mammals类中的Homosapien