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单细胞基因组、转录组分析
单细胞分析可解决由于样品稀少或异质所产生的困难。首先须对单细胞基因组、转录组进行扩增。
单细胞扩增存在的技术挑战:
单细胞扩增不可重复
过大的扩增偏倚、随机扩增
基因组某些位点无法扩增
7
MALBAC单细胞全基因组扩增技术
多次退火循环扩增技术 (Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles)
哈佛大学终身教授,美国科学院院士
谢晓亮教授 团队
8
MALBAC全基因组扩增
扩增单细胞基因组上百万倍
90%的位点可被成功扩增
最低模板量:单细胞、单染色体或0.5pg基因组DNA。
扩增产物可用于基因克隆、qPCR、微阵列、二代测序等各种平台。
扩增均匀性
与同类产品(Qiagen及GE基于MDA技术的全基因组扩增试剂盒) 的比较:
10
单细胞CNV(Copy number variation)分析
11
单细胞SNV(single nucleotide variation)分析
12
MALBAC技术参考文献
单细胞测序新技术—MALBAC技术
1. Zong C, Lu S, et al., Science. 338:1622 (2012)
使用MALBAC技术首次绘制高覆盖度单精子基因图谱
2. Lu S, et al., Science. 338:1627 (2012)
MALBAC技术主要研发人之一Sijia Lu现为亿康基因技术总监,亿康基因将基于MALBAC技术,协助中国及世界各地的科研人员做出优秀的研究成果!
单细胞基因组扩增、测序服务
基于必威体育精装版的MALBAC技术。
扩增单个细胞基因组达上百万倍。
90%的位点可被成功扩增。
最低模板量:单细胞、单染色体或0.5pg 基因组DNA。
扩增均匀性显著好于同类产品。
扩增产物可用于基因克隆、荧光定量PCR、微阵列、二代测序等平台。
单细胞转录组扩增、测序服务
基于必威体育精装版的MALBAC技术
扩增单个细胞转录组达上百万倍。
90%的表达基因可被成功扩增。
最低模板量:单细胞或0.5pg poly-A(+) mRNA。
扩增均匀性显著提高,结果具可重复性。
扩增产物可用于基因克隆、荧光定量PCR、微阵列、 二代测序等平台。
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