TCGA及SEER癌症公共数据库数据挖掘方法与应用.pdf

郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX educationtrainingcenter) 第十二期基于 及 等癌症公共数据库 TCGA SEER 的信息挖掘和科研设计 （实操篇）会议通知 各事业单位： 身处大数据时代，对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员，有没有一种可以既不做 实验又不查病史，直接调用公共数据撰写发表SCI 论文的方法呢？TCGA 和SEER 等癌症公 共数据库即提供了这样一种可能。TCGA 和SEER 分别侧重于组学数据和临床数据，各有优 势。TCGA （癌症基因组图谱）数据库是一个多组学的数据库，包括常见癌症的基因组、转 录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据，为挖掘有意义的组学变化和发现肿 瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的SEER （癌症监测、流行病学和 结果）数据库则是典型的临床医学数据库，是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之 一，收集了各个癌种的海量临床病理信息和预后数据，并向全世界免费开放，为临床医师的 循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计，全世界基于TCGA 和SEER 数据挖掘产生的文章已经超过2000 篇，其中不乏最顶尖的学术期刊文章 （如JAMA、新英格 Nature Cell 兰、 、 等），这一数目还在不断增长中。 以往的TCGA 课程往往侧重于R 语言程序的讲解，不少学员反应难以掌握。本课程立足 应用和实战，宗旨是 “临床医生听得懂、学得会，科研人员亦有收获”。本课程将从临床应 用视角介绍癌症公共数据库TCGA、SEER 的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本 统计方法等，深度解析近年讲课人发表的基于TCGA 和SEER 数据挖掘的经典案例，重点对 癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论，最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI 论文撰写策略。 一、时间地点： 2019年 1月25 日--1月27 日 北京站 （北京冠京饭店） 2019年3月15 日--3月17 日 济南站 （和颐酒店） （日程安排：第一天报到，授课两天；） 二、学习目标： 本次培训提供了一次系统掌握TCGA 和SEER 等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及 分析流程的机会，目的在于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研 人员，帮助研究者去更好地挖掘利用这些免费的公共数据。 1 TCGA 本次培训不侧重于深入的生物信息学分析讲授，拟解决的问题包括： 、如何基于 SEER 2 TCGA SEER 3 及 等癌症公共数据库设计课题； 、 及 数据库的数据下载； 、获取数据 后如何分析；4、如何在此基础上撰写SCI 论文及申请科研基金。 三、授课方式: 1、上机操作； 2、专题小组研讨与案例讲解分析结合； 3、课程讲座； （主题明确，针对性强。专题小组研讨与案例讲解分析结合。） 郑州晟智科信企业管理咨询有限公司 二零一八年十二月五日 郑州晟智科信教育培训中心(Zhengzhou SZKX educationtrainingcenter) 四、主讲专家: 本次主讲老师是来自国内知名三甲医院肿瘤专业的临床医生和科研工作者，有着丰富的临 SCI 26 10 4 床和转化研究经验。以一作和通讯作者发表 论文 篇， 分以上论文 篇，累计影响 因子176。其中成功用TCGA、SEER 数据库发表十几篇SCI，平均影响因子4.6分一篇。目 前主持国家自然科学基金面上项目及多项省部级人才项目，担任一本SCI 杂志的