oseqctdna无创肿瘤个体化诊疗基因检测20150204.doc

Oseq?-ctDNA无创肿瘤个体化诊疗 主讲人：钟晶 联系方式：zhongjing@genomics.cn 产 品 介 绍 客 户 分 析 市 场 部 的 支 持 产 品 介 绍 客 户 分 析 市 场 部 的 支 持 OseqTM –ctDNA无创个体化诊疗基因检测 循环肿瘤DNA (circulating tumor DNA, ctDNA)是 肿瘤细胞破碎、凋亡后进入血液循环系统中的、 大小通常为160‐180 bp的DNA片段。 Targeted therapy Brain tumor DNA blocked by blood-brain barrier Response to therapy Breast cancer Pancreatic cancer Resistance mutation #2 Selective pressure Colon cancer Resistance mutation #1 综合 ctDNA可以体现患者体内肿瘤的综合情况。 灵敏 较之于其他类型的肿瘤标记物，ctDNA具有更 高的敏感性，可更早地反映肿瘤的进展情况。 无创 只需抽取外周血即可完成对肿瘤细胞DNA的分 析和解读 通过采集外周血，对外周血血浆中的 ctDNA（循环肿瘤DNA）进行测序， 可以精确的分辨出血液循环DNA中的 肿瘤来源DNA片段。 OseqTM –ctDNA无创个体化诊疗基因检测 无创 检测对象 ?仅需抽取少量外周血 ?无需手术/穿刺 ?癌症中晚期/复发/转移无法手术患者 ?原治疗方案效果不佳，需更换药物患者 用药解析 ?SNV/Indel/CNV/SV ?508个肿瘤相关基因 ?88种药物：靶向药物+化疗药物 高通量测序 ? 10个工作日出具报告 Oseq?-ctDNA检测内容 5 mL外周血 结直肠癌 肾癌 食管癌 乳腺癌 卵巢癌 508个基因 宫颈癌 肺癌 胃癌 前列腺癌 2014年底转产时已完成临床样本癌症分类情况 骨肉瘤, 4 肾癌, 4 食道癌, 4 胰腺癌, 6 肺癌, 49 其他类, 21 卵巢癌, 17 乳腺癌, 35 结直肠癌, 18 胃癌, 18 癌症类型及检测数量，Total N=176 临床样本检测成功率 临床样本检测成功率99% 180 160 140 120 100 80 60 40 20 0 总体 提取 文库构建 上机测序 （98%） （99%） （99%） （100%） Total 176 176 174 172 Success 173 174 172 172 ?3例样本因样本质量不合格失败： ? 严格质控收样环节，避免剧烈摇晃收集管导致细胞破裂（轻柔颠倒6-8次） ? 从取样到分离，streck管最长保存时间72h 临床样本Actionable Variation检出情况 Actionable variation类型 21% 7% 72% CNV/SV InDel/Frameshift SNV 对中晚期/转移/治疗无效患者的用药阳性检出率为41% 案例1 无创检测，为肿瘤患者寻找新的治疗药物 临床背景： 女性，51岁，2003年诊断为乳腺浸润性导管腺癌，ER和PR阳性，进行了保乳根治性 手术，并一直在接受激素治疗。2014年7月份发现癌症复发，并出现骨转移。 由于无法手术再获取肿瘤组织进行药物基因检测，患者抽取5 mL外周血送到华大医 学，进行了Oseq?-ctDNA无创肿瘤个体化诊疗基因检测。 Oseq?-ctDNA检测结果： PIK3CA H1047R 该突变使得PIK3CA持续活化，从而导致其下游mTOR通路被激活，造成肿瘤病情发 展。 治疗方案： 基于Oseq-ctDNA检测结果，患者使用了mTOR抑制剂。mTOR抑制剂能抑制mTOR 通路过度活化，FDA批准用于进展期乳腺癌。 治疗结果： 在服用mTOR抑制剂三个月后，患者的骨转移得到缓解，没有出现新的转移灶。对于 这个患者，华大医学在进行进一步的跟进和服务。 案例2： 早期辅助诊断---科研 女性，肺部结节 性质难以判断 现有的临床确诊方法 穿刺/手术获得组织样本 进行病理验证 弊端： 1、对患者的创伤性大 2、恶性易出现转移 3、部分良性患者带来不必要的创伤 ? 应用Oseq-ctDNA检测技术，发现9个已被报道的和肺癌密切相关的基因/位点发生 变异 ? 基于Oseq-ctDNA检测结果，医生做出手术决策，术后取得组织经过鉴定确实为肺 癌。 传统方法与Oseq?-ctDNA综合比较 检测项目 基因数 检测对象 采样方式 适用情况 应用领域 Oseq?-ctDNA 508 5ml 全血 无创 无特殊要求 用药指导 耐药分析 病因查找 单基因检测 单个 组织 活检/手术 活检和手术的 患者，且一般 只有一次取