蛋白晶体结构作业.pdf

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生物大分子结构与功能 1、 什么叫晶体衍射得结构因子?结构因子 F 与晶体衍射得衍射点得强度 I 有什 么关系? 结构因子就是定量表征原子排布以及原子种类对衍射强度影响规律得参数, 即晶体结构对衍 射强度得影响因子。 晶体 X 光衍射强度与几何结构因子得平方成正比 2、 什么叫傅里叶变换?用公式说明为什么说蛋白质晶体得电子密度与晶体衍 射得结构因子互为傅里叶变换与反变换得关系? The Fourier transform is a mathematical operation that decomposes a function into its constituent frequencies, known as a frequency spectrum 、 The term Fourier transform refers to both the transform operation and to the complex-valued function it produces 、 结构因数同电子密度分布函数之间存在着傅里叶变换得关系: 由傅里叶变换公式得: for every real number ξ、 When the independent variable x represents time (with SI unit of seconds), the transform variable ξ represents frequency (in hertz) 、 Under suitable conditions, ? can be reconstructed from by the inverse transform : for every real number x 、 晶体对 X 射线得衍射就是一种傅里叶变换,把正空间得电子密度变换为倒易空间得衍射强 度。 3、 什么叫两个函数得卷积( convolution )?两个函数得卷积得傅里叶变换与这 两个函数得傅里叶变换有什么关系? In mathematics and in particular functional analysis, convolution is a mathematical operation on two functions f and g, producing a third function that is typically viewed as a modified version of one of the original function 、 两函数得傅里叶变换得乘积等于它们卷积后得傅里叶变换。 It also works the other way around: 4 、 为什么说晶体得电子密度就是晶体里一个晶胞得电子密度与该晶体得晶格 得卷积? 5、 用两个函数得卷积得傅里叶变换得性质推导晶体得 X 射线衍射得结构因子 与晶体里一个晶胞得 X 射线衍射得结构因子得关系。 Ihkl =|Fhkl | 2 、Ie 若亚晶块得体积为 VC 0 ,晶胞体积为 V ,则: C 0 N=V /V 这 N 个晶胞得 HKI 晶体衍射得叠加强度为: 考虑到实际晶体结构与之得差别,乘以一个因子, ,则可得: 6、 为什么通常用同晶置换法解蛋白质晶体结构时需要至少两个重原子衍生 物? 同晶置换法需要制备同晶型得重原子衍生物﹐即在不会改变分子与晶体结构得情况下﹐在 晶体中引入一种较重得金属原子。 这些金属原子在晶体中以与其它原子相同得周期重复规律 排列。它们对于 X 射线得散射仅影响晶体得衍射强度﹐而不改变衍射方向。这时重原子得 结构振幅可由衍生物与天然晶体衍射强度得差值求得。由于晶体中引入重原子得数目有限 ,

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