R语言绘图：相关性分析报告及绘图展示.pdfVIP

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2020-09-13 发布于湖北
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R语言绘图：相关性分析报告及绘图展示.pdf

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实用标准文案相关性分析 gaom 在我们平时分析的时候，经常会遇到样品间的相关性检验分析，并以此判断对我们后续分析的影响。今天主要跟大家讨论一下简单的相关性分析以及结果展示。利用的测试数据还是之前我们在 geo 数据库中随便找的一份表达谱数据。首先还是导入数据，进行简单分析，获取相关数值。 rm (list= ls ())# 先把我们的 R 清空一下 data- read.table (file = C:\\Users\\gaom\\Desktop\\R 语言绘图相关性分析 \\test_ data.txt ,header = T, row.names = 1 ,sep= \t )# 读取数据 cor (data, method = pearson )# 方法可选 pearson 、kendall 、spearman 。 ## T01 T02 T03 T04 T05 T06 T07 ## T01 1.0000000 0.9626878 0.9820587 0.9775637 0.9672888 0.9664156 0.97526 35 ## T02 0.9626878 1.0000000 0.9871793 0.9739935 0.9779155 0.9794141 0.97864 00 ## T03 0.9820587 0.9871793 1.0000000 0.9823576 0.9819684 0.9808063 0.98333 52 ## T04 0.9775637 0.9739935 0.9823576 1.0000000 0.9915693 0.9890907 0.98157 30 ## T05 0.9672888 0.9779155 0.9819684 0.9915693 1.0000000 0.9943036 0.98053 66 ## T06 0.9664156 0.9794141 0.9808063 0.9890907 0.9943036 1.0000000 0.97984 87 ## T07 0.9752635 0.9786400 0.9833352 0.9815730 0.9805366 0.9798487 1.00000 00 ## T08 0.9714801 0.9791369 0.9816482 0.9814655 0.9804464 0.9796599 0.99386 47 ## T09 0.9746475 0.9802358 0.9845114 0.9814857 0.9800746 0.9794935 0.99474 28 精彩文档实用标准文案 ## T10 0.9636498 0.9717902 0.9757652 0.9759936 0.9771073 0.9755922 0.98503 77 ## T11 0.9739732 0.9677072 0.9775576 0.9796979 0.9778722 0.9760231 0.98765 67 ## T12 0.9613186 0.9685109 0.9732389 0.9739145 0.9757272 0.9737234 0.98559 69 ## T08 T09 T10 T11 T12 ## T01 0.9714801 0.9746475 0.9636498 0.9739732 0.9613186 ## T02 0.9791369 0.9802358 0.9717902 0.9677072 0.9685109 ## T03 0.9816482 0.9845114 0.9757652 0.9775576 0.9732389 ## T04 0.9814655 0.9814857 0.9759936 0.9796979 0.9739145 ## T05 0.9804464 0.9800746 0.9771073 0.9778722 0.9757272 ## T06 0.9796599 0.9794935 0.9755922 0.9760231 0.9737234 ## T