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实验一 CTAB法提取植物基因组DNA
实验目的:
学习从植物组织中 (幼叶)提取基因组DNA 的基本原理和方法。
实验原理:
采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶
类 (尤其是氧化酶类),其对DNA 的抽提产生不利的影响,所以在抽提缓冲液中
需加入抗氧化剂或强还原剂 (如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研
磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵) ,是一
种阳离子去污剂,可溶解细胞膜并与核酸形成复合物。
该复合物在高盐的溶液中(0.7mol/L NaCl )是可溶的,通过有机溶剂抽提,
去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀 (CTAB能溶于乙醇)即可使核酸
分离出来。
CTAB溶液在低于15度时会形成沉淀洗出,因此再将其加入冰冷的植物材料
中之前必须预热(65度),且离心温度不要低于15度。
实验步骤:
1、取幼嫩的植物叶片(3-5g )剪碎液氮研磨成粉,转入1.5ml离心管内。加
入等体积的65℃预热的DNA提取缓冲液置于65℃的恒温水浴摇床上1-2h(1.5h) 。
2 、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),轻轻上下颠倒5分钟,静置5分钟,
之后于12000rpm离心10分钟。
3、吸取上层水相,重复步骤2一次。
4 、吸取上层水相,加入预冷2/3体积的异丙醇,轻缓颠倒2分钟并置-20 ℃冰
箱内10min,待DNA沉淀后于12000rpm离心收集,收集的DNA于70% 乙醇中洗2-3
次。将弃去乙醇风干后的DNA加适量水使其溶解。
5、待DNA完全溶解后加入1-2μl不含RNAaseA (10mg/ml),37℃保温1h以除
去DNA 中的RNA 。
6、于Eppendorf管中加入1mL氯仿:异戊醇 (24 :1)轻轻上下颠倒10分钟后
10000rpm离心10分钟。
7 、吸取上层水相并先后加入1/10体积的3M醋酸钠及2倍总体积的预冷的无
水乙醇,接着置于-20 ℃冰箱,10分钟后10000rpm离心10分钟,弃去无水乙醇,
1
加入70 %乙醇洗涤2-3次,风干,最后将DNA溶于适量(200-500μl) TE 中。
8、待DNA完全溶解后进行1%琼脂糖凝胶电泳,检查DNA 的质量并据已知
的DNA 分子量标准估计其浓度。调整浓度后的DNA置于-20 ℃备用。
实验试剂:
1、1M Tris-HCL (pH8.0 )
121.1g Tris溶于800ml无菌水中,加浓HCL调pH到8.0,定容至1L,高压灭菌。
2、0.5M EDTA (pH8.0 )
186.1g EDTA-Na·2H O溶于800ml无菌水中,需用磁力搅拌器剧烈搅动,用
2
NaOH调pH值到8.0 (约20g ),定容至1L,高压灭菌。
3、3.5M NaCL
204.75g NaCL溶于1L无菌水中,高压灭菌。
4、10% CTAB溶液
10gCTAB溶于80ml无菌水中,定容至100mL,高压灭菌。
5 、DNA提取
3.5M NaCL 200ml
液(500ml )
Tris-HCL 50ml
EDTA 50ml
10%CTAB 100ml
Water 100ml
6、氯仿-异戊醇(24:1体积比)
7、RNAaseA
8、异丙醇
9、无水乙醇
10、3M醋酸钠
11、1×TE缓冲液
实验仪器:
液氮罐、1.5
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