NGS实验室建设实用标准与要求｜喜格.docx

实用标准文案 NGS 实验室建设标准与要求 一、高通量测序（ NGS）实验室简介 1.1 NGS实验室又叫高通量测序检测实验室。 NGS是下一代测序技术 ( NEXT GENERATIONSEQUENCING)即高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传 统 SANGER测序（称为一代测序技术）革命性的改变 , 可同时对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定， 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能 , 也称为深度测序 (DEEP SEQUENCING)。 1.2 由于 NGS技术对所检测的核酸模板进行大量扩增， 容易出现实验室污染导致检测结果准确性下降；另外 NGS技术要求高、影响因素多，实验过程处理不当易导致检测结果准确性下降或检测失败。 因此临床基因扩增检验实验室技术验收和规范化管理是 NGS技术本身需要，也是在临床上顺利应用该技术前提。 二、 NGS实验室临床应用的基本条件 2.1 必须拥有符合临检中心相关规定的标准 NGS实验室。 2.2 检测设备必须符合标准 NGS实验室设置要求： 高通量测序仪及配套服务 器；高通量测序检测试剂盒；通用电脑；自动分析软件，实验室样本信 息管理系统等。 2.3 检测人员必须通过专门的技能培训， 并获得省级以上卫生计生行政部门 颁发的临床基因扩增检验技术上岗证书。 NGS实验室必须建立严格的实 验室管理制度、建立标准化操作程序（ SOP）、建立系列质量管理文件 等，确保实验室日常运行符合国家卫生部的要求，确保检测结果准确、 确保实验室卫生安全，确保实验室长期稳定运行。 2.4 NGS临床应用必须在无菌无尘环境下进行操作。 三、 NGS实验室建设基本要求 3.1 主体结构 文档大全 实用标准文案 主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金 50 内圆角铝，从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固，线条简明，美观大方，密封性好。 3.2 标准的各区分隔和气压调节 将检测过程分成试剂准备、样本制备、 PCR扩增和高通量测序四个独立的实 验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区， 同时各区通过气压调节， 使整个检测实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。 可打开缓冲区和 PCR扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口，空气通过回风口向室内换气。 3.3 消毒 在每个实验区和缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯，供消毒用。在各 区还设置移动紫外线灯，对实验桌进行局部消毒。 3.4 机械连锁不锈钢传递窗 试剂和标本通过机械连锁不锈钢（不建议使用电子连锁方式）传递窗传递， 保证试剂和标本在传递过程中不受污染（人物分流）。 3.5 地面 地面建议使用 PVC卷材地面或自流坪地面，整体性好。便于进行清扫，耐腐 蚀。没有条件的也可采用水磨石地面，或大块的瓷砖（至少 800MM×800MM） 接缝需要小于 2MM。 3.6 照明 灯具要选用净化灯具，能达到便于清洗、不积尘的特点。 3.7 平面布局 文档大全 实用标准文案 NGS实验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定 分区的多少及各区域的空间大小， 至少具体需要多少个区， 同样是“个体化”的，以“工作有序、互不干扰、防止污染、报告及时”作为基本原则。 四、各项目实验室建设标准 产前筛查与产前诊断（全基因组低拷贝测序技术） 实验室平面图 图 1：产前筛查与诊断实验室平面图 技术流程图 图 2：产前筛查与诊断技术流程图 技术参数 文档大全 实用标准文案 分区 压力 温度 相对湿度 照明 专用走廊 0Pa 缓冲区 +5Pa 试剂准备室 +15Pa 标本与文库制 +10Pa 20-25 ℃ 40%~60% 主实验室≥ 300LX，其 备区 余房间 200～300LX 文库扩增与检 -5Pa 测区 测序区 -10Pa 分区功能 4.1 试剂准备室 主要功能：在 NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。 4.2 标本与文库制备区 主要功能：血液处理、血浆制备、 DNA提取、 DNA片段化、 DNA样品的纯化、 DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。 4.3 文库扩增与检测区 主要功能：文库构建后的 PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混 合后的质检分析。 4.4 测序区 主要功能：测序模板制备（乳液 PCR与磁珠富集回收）、上机测序、数据分析、报告审核及发放。 仪器配置 5.1 试剂准备室 文档大全 实用标准文案 主要仪器设备：加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、 移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。 5.2 标本与文库制备区 主要仪器设备：冷冻离心机、