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siRNA 使用说明 (2009-08)
名称:
常规化学合成siRNA。
产品简介:
常规化学合成siRNA为21-25nt,带有2nt 的 3端悬垂的双链小RNA(3端悬垂通常为dTdT或者UU,也可以选择其他的碱
基作为3端悬垂)。
产品剂量经过严格测算,以摩尔数标明。产品剂型为冻干粉,即用型的 siRNA 已经经过去保护、退火、纯化等处理,只要
用灭菌的 ddH2O 或者RNase-free water溶解并配制成20μM液体即可直接用于细胞转染及其他实验。
保存和使用:
保存: 液体剂型,siRNA的贮存浓度一般为20μM,-20℃或-70℃保存半年以上;
冻干粉剂型,-20℃或-70℃保存一年以上。开盖前,请先稍稍离心,将粉末收集管底,再用灭菌的 ddH2O 或者RNase-free
water,配制成20μM的液体剂型。
例如:20nmolsiRNA冻干粉,需要加入1ml 水溶解(其他剂量可以按照比例计算加水量)。
注意:(1)液体剂型产品,应避免反复冻融(尽量不要超过 5 次),建议溶解后的产品分装保存。(2)如果近期不做实
验,产品需要长期放置,最好以冻干粉形式保存。
使用: 产品使用时(转染过程),siRNA 最好冰上放置,使用完毕,请于-20℃或-70℃小心保存;
整个实验过程,要求无 RNA 酶环境,枪头、EP管都要经 DEPC处理;
特别提示:荧光标记 siRNA 要求避光。
使用方法:
1. siRNA 的转染浓度:推荐的siRNA转染浓度是 50nM,客户可根据实验具体情况优化转染浓度,优化的范围可以是10~150nM。
(siRNA及转染试剂的建议用量,请参照“实验指导”)。
2. 使用 lipofectamine2000(Invitrogen)转染 siRNA 的步骤(仅供参考):
(1) 转染前一天,接种适当数量的细胞至细胞培养板中,使转染时的细胞密度能够达到 30~50% (不同细胞生长速度不一样,
因此,接种细胞的数量需要根据细胞培养的经验),请使用无抗生素的培养基。
注意:转染时,细胞密度是影响转染效率的关键因素之一,细胞生长过度会削弱细胞活力,从而降低细胞的转染效率。而
细胞密度过低则可能达不到生长的要求,也会因此影响转染效率。
(2) 对于每个转染样品,按如下步骤准备 siRNA- lipo2000 混和液(试剂的用量和体积,请参照 “实验指导”):
a. 稀释转染试剂 lipofectamine2000 (以下称lipo2000 ):使用前,将lipo2000 转染试剂轻轻摇匀,然后取适量,用不含血清
的优化培养基(Opti- MEM Ⅰ)稀释,轻轻混和,室温孵育5min;
b. 稀释 siRNA:用不含血清的Opti -MEM Ⅰ稀释siRNA,轻轻混和;
c. 稀释好的 lipo2000 经过 5min 的孵育后,将之与上述(b )稀释好的siRNA 轻轻混和,室温培养20min 以形成siRNA-lipo2000
混和物,溶液可能会有浑浊,不过不会影响转染。
注意:稀释好的 lipo2000,如果长时间放置可能导致转染试剂活性的降低,应尽量在 30min 之内与稀释好的 siRNA 混和。
(3) 将 siRNA-lipo2000 混和液加入含有细胞以及培养液的细胞培养板中,轻轻摇晃,使之混和;
(4) 将培养板置于 37 ℃的 CO2 培养箱中培养至检测时间(24~96h )。沉默效率的检测一般建议的时间为24~72h 。
可选操作(并非必要的操作):转染操作完成,经过 37℃培养 4~6h 后,可以将孔里含有 siRNA-lipo2000 混合液的培养基
移去,更换新鲜的生长培养基,这样也不会影响转染的效率。
注意:如果转染时使用的是不含血清的培养基(即血清饥饿的条件下进行转染),4~6h 后必须换成完全培养基(含血清、
含抗生素),以确保细胞生长。
3. mRNA 水平的检测:siRNA 的作用机理在于其引起靶 mRNA 的降解,因此 mRNA 的降解水平是 siRNA 沉默效率的最直接指标。
一般在siRNA 转染后24h即可以检测到靶mRNA水平的降低。检测方法一般采用RT-PCR(半定量)或Real-time PCR(定量)。
4. 蛋白水平的检测:蛋白水平的检测一般需要借助抗体
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