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流感病毒快速检测方法
TOC \o 1-2 \n \h \z \u 一、 RT-PCR快速诊疗方法
(一) 生物安全要求
(二) 病毒核酸提取
(三) RT-PCR
(四) PCR 产物纯化
(五) 流感病毒RT-PCR检测引物
二、 免疫荧光方法检测流感病毒
(一) 原理
(二) 标本处理
(三) 间接免疫荧光法
(四) 结果判定
三、 实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)快速诊疗检测
(一) 基础原理
(二) 试验试剂
(三) 试验步骤
四、 快速诊疗试剂盒
流感快速检测方法,和传统病毒分离判定相比含有快速、简便特点。所以常见于流感暴发时早期病原学检测用。流感快速诊疗包含直接和间接免疫荧光法、ELISA、RT-PCR、Real-Time PCR快速诊疗速方法、流感快速诊疗试剂盒等。这里介绍RT-PCR、Real-Time PCR、免疫荧光快速诊疗速诊疗方法和多个流感快速诊疗试剂盒优缺点。不管那种快速诊疗全部无法替换传统病毒分离判定方法。
RT-PCR快速诊疗方法
核酸检测是一个判定流感病毒基因组有力方法,即使基因组含量很低或死病毒也能够检测到。本章将介绍检测流感病毒聚合酶链式反应(PCR)。
流感病毒基因组是负链RNA,在进行PCR扩增前必需合成和病毒RNA互补DNA,即为cDNA。逆转录酶(RT)就是用于合成cDNA多聚酶,所以,扩增流感病毒基因组过程称为RT-PCR。
RT-PCR需要一对型别特异引物,四种脱氧核苷酸(dNTPs),RNA模板,逆转录酶及Taq DNA 多聚酶;首先由逆转录酶将病毒RNA逆转录合成cDNA,然后再进行聚合酶链反应经25~30个循环,使DNA产物达成倍增效果。
生物安全要求
生物安全等级和个人防护要求:生物安全二级试验室,防护要求和二级试验室要求相同。并应遵守对应生物安全要求。进行高致病性禽H5 RT-PCR快速检测时能够在生物安全二级试验室里进行,核酸提取在生物安全三级试验室生物安全柜里完成。
病毒核酸提取
试验材料及仪器
QIAGEN企业Rneasy Mini Kit(Catalog# 74104)
β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol)
70% 乙醇
无菌1.5ml 离心管
10μl、20μl、200μl、1000μl加样器和枪头
可调14K微型离心机
旋转混合器
操作步骤
取1支无菌、无RNA酶1.5ml Eppendorf管,加入500μl RLT。
取采样液(鼻拭子、咽拭子、胸水等)或病毒培养物(鸡胚尿囊液或细胞培养液)100μl,加入上述Eppendorf管中。
加5μl β-巯基乙醇,充足混匀。
加600μl 70%乙醇,于旋转混合器混匀。
从试剂盒中取出带滤膜离心柱,并标上标本号。
将第4步混合液体分两次(每次600μl) 吸入于滤柱中,1rpm 离心15秒,弃搜集管中离心液。
滤柱仍放回搜集管上,将第4步混合液全部吸入滤柱中,1rpm 离心15秒,弃搜集管中液体。
于滤柱中加入700μl RW1,1rpm 离心15秒。
从试剂盒中取出一支新2ml搜集管,将离心后滤柱转到新搜集管上,于柱子中加入500μl RPE,1rpm 离心15秒弃搜集管中液体。
滤柱放回搜集管上,于滤柱中加入500μl RPE,13000~14000rpm 离心2分钟。
从试剂盒中取出一支1.5ml Eppendorf管,将滤柱转到新1.5ml管上,于滤柱中加入30~50μl 无RNA酶水,室温静置1~3分钟。
1rpm 离心1分钟,弃滤柱。搜集离心液即为提取病毒RNA,能够直接用于逆转录试验,或在-20℃以下保留,-30℃可保留3~4个月。
注意事项
试剂盒中RPE液用前需加44ml无水乙醇,使终体积达成55ml。
全部用过枪头、搜集管放入2%次氯酸钠消毒缸中过夜。
RT-PCR
一步法 RT-PCR
试验材料
QIAGEN One Step RT-PCR Kit Cat No 210212
RNase inhibitor 40u/μl(Promega)
上游引物 200ng/μl
下游引物 200ng/μl
模板RNA(Templet RNA)
试验步骤
PCR反应配置(在清洁区缓冲间,加RNA模板应在核酸室)
无RNA酶水(Rnase Free Water) 28.75μl
5×Buffer 10μl
10mM dNTP 2μl
Enzyme Mix 2μl
Rnase inhibitor
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