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第三章 生物信息的传递(上);第三章 生物信息的传递(上);第三章 生物信息的传递(上);第一节 转录的基本过程;第一节 转录的基本过程;2. 转录起始
RNA聚合酶结合到启动子上以后,使启动子附近的DNA解旋并解链,形成转录泡以促使核糖核苷酸与模板DNA配对。
转录起始即是RNA链上第一个核苷酸链的产生。
无需引物。
起始后直到形成9个核苷酸的过程是通过启动子阶段,此时RNA聚合酶一直在启动子处,之后进入正常延伸。;3. 转录延伸
转录延伸即是RNA聚合酶释放σ因子离开启动子后,核心酶沿着模板DNA移动并使新生RNA链不断伸长的过程。
4. 转录终止
当RNA链延伸到终止位点时,RNA将停止合成,转录泡瓦解,DNA链复原,新生RNA链和RNA聚合酶将被释放下来。这即是转录终止。;第二节 转录机器的组成;第二节 转录机器的组成;第二节 转录机器的组成;原核生物RNA聚合酶
转录的其实过程需要全酶,延伸过程仅需要核心酶。
各亚基的功能:
β亚基和β’亚基组成了聚合酶的催化中心,它们在序列上与真核生物RNA聚合酶的两个大亚基同源。 β亚基能与模板DNA、新生RNA链及核苷酸底物相结合。
α亚基可能与核心酶的组装及启动子的识别有关,并参与RNA聚合酶和部分调节因子的相互作用。;各亚基的功能:
σ因子的作用是负责模板链的选择与转录的起始,它是酶的别构效应物,使酶专一性识别启动子。
提高酶对启动子的亲和力,酶底结合常数提高103倍
降低酶对非专一性位点的亲和力,非特异性结合常数降低104倍
某些细菌内含有能识别不同启动子的σ因子。;第二节 转录机器的组成;第二节 转录机器的组成;第二节 转录机器的组成;第二节 转录机器的组成;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第三节 启动子与转录起始;第四节 mRNA的特征;第四节 mRNA的特征;第四节 mRNA的特征;2. 真核核生物mRNA的特征
5’端加帽反应在转录早期即已完成。帽子结构有三种不同甲基化形式。
帽子的作用可能使mRNA免遭核??酶的破坏。
甲基化的帽子也可能是蛋白质合成起始信号的一部分。;2. 真核核生物mRNA的特征
多聚尾巴是在转录后,由内切酶切开mRNA3’端的特定部位,然后由poly A 聚合酶催化多聚腺苷酸反应。
Poly A是mRNA进入胞质必需的形式,增强稳定性。
;第五节 终止和抗终止;第五节 终止和抗终止;第五节 终止和抗终止;1. 不依赖于ρ因子的终止
新生RNA中出现发卡结构可导致RNA聚合酶暂停,破坏RNA-DNA杂合链5’端正常结构,寡聚U是杂合链3’端部分出现不稳定rU·dA区域。新生RNA链将解离出来。
终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关。;2. 依赖于ρ因子的终止
有些终止点的DNA序列缺乏共性,不能诱导转录的自发终止,需要ρ因子的参与。
“穷追”模型
大肠杆菌ρ-依赖型终止子占所有终止子的一半左右。;第五节 终止和抗终止;第五节 终止和抗终止;3. 抗终止
依赖于蛋白质因子的转录抗终止
蛋白复合物形成后,将会改变聚合酶的构象,使之对终止信号不敏感,从而抗终止。
;第六节 mRNA的加工;第六节 mRNA的加工;第六节 mRNA的加工;1. RNA中的内含子
内含子两端边界存在共有序列:(GU-AG法则)
在内含子内部部分序列也可能参与内含子的剪接,他们可能是pre-mRNA剪接过程中各种核糖核蛋白剪接调节因子的结合位点。;2. mRNA的剪接
许多相对分子质量较小的核内RNA(如U1,U2,U3,U4,U5和U6)以及与这些RNA相结合的核蛋白参与RNA的剪接。;2021/1/1;2. mRNA的剪接
内含子的末端识别有内含子限定和外显子限定两种方式。;2. mRNA的剪接
生物体内各种内含子:
与mRNA前体中主要(GU-AG类)和次要(AU-AC类)内含子剪接方式不同,I、II类内含子能进行自我剪接。;3. RNA的编辑、再编码及化学修饰
RNA的编辑
RNA的编辑是某些RNA,特别是mRNA前体的一种加工方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,导致DNA编码的遗传信息的改变。
介导RNA编辑的机制有两种:
位点特异性脱氨基作用
引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除。;位点特异性脱氨基作用
载脂蛋白C→U导致提前终止
由脱氨基酶催化;引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除;引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除;3. RNA的编辑、再编码及化学修饰
RNA的编辑
RNA的编辑的生物学意义:
校正作用 有些基因在突变过程中
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