diamond如何找寻经典氢键以及画出.docVIP

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2021-02-06 发布于河北
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找寻氢键的方法：首先，用shelxtl软件新建项目，用XSHELL打开要找氢键的res文件，删除Q峰，编辑现在的文件，在命令行输入htab，换行输入CONF，保存文件，删除Q峰，refine，并checek CIF，没问题后，找到LIS文件，查找bonds，找到经典相关信息画氢键的方法：打开Daimond 3 按提示打开晶体CIF文件，销毁所有原子，点击build，然后fill，superfill，选择3*3*3，确定；删除跟氢键无关的氢原子；点击connectivity设置键长和键角；点击连接所有原子；随机选取最长片段并复制；销毁所有原子并粘贴；最后精修。