MEGA计算序列间遗传距离.docx

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2021-03-31 发布于天津
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序列间遗传距离的计算导入比对好的格式数据数据划分序列数据的基因和域的指定和选择在中可对指定范围的序列位点进行分析虽然经过比对和剪切后的序列通常都可全长用于分析但对于蛋白质编码基因序列来说序列的第一位并非总是密码子的第一位此时要通过该设置指定密码子是从序列的第几位开始要先通过翻译确定否则软件会将序列的第一位默认为密码子的第一位具体的操作是点击在主窗口和数据管理窗口均可进行此设置在弹出的小窗口中进行设置选项用于设置分析的起始位点用于设置分析的终止位点设置完成后会在项显示出选定范围内的位点总数用于设置

序列间遗传距离的计算导入比对好的“ *.meg ”格式数据。数据划分（ 1）序列数据的基因和域（ genes domains）的指定和选择在 MEGA 中可对指定范围的序列位点进行分析。虽然经过比对和剪切后的序列通常都可全长用于分析，但对于蛋白质编码基因序列来说，序列的第一位并非总是密码子的第一位，此时要通过该设置指定密码子是从序列的第几位开始（要先通过 Spin 翻译确定），否则软件会将序列的第一位默认为密码子的第一位。具体的操作是：点击“ Data→ Setup/Select Genes Domains ”（在主窗口和数据管理窗口均可进行此设置），在弹出的“