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第一节 基因工程中的工具酶;一、限制性内切酶;(一)、限制修饰系统的种类;(二)、限制性内切酶的定义、命名;(三)、限制酶的特点; 3)对称性—双对称
EcoRI 5’-G A A T T C-3’
3’-C T T A A G-5’
4)切点大多数在识别顺序之内,也有例外
5)限制酶切后产生两个末端,末端结构是5’-P和3’-OH
2.??末端种类
1)3’-端突起,个数为2或4个核苷酸
Pst I 5’-CTGCAG-3’ 5’-CTGCA G-3’
3’-GACGTC-5’ 3’-G ACGTC-5’
2)5’-端突起,个数为2或4个核苷酸
EcoRI 5’-GAATTC-3’ 5’-GOH PAATTC-3’
3’-CTTAAG-5’ 3’-CTTAAP HOG-5’
粘性末端能与另一个相同的粘连末端相连接,任何两个具有相同识别位点的DNA分子经限制酶切割后能够重新连接成新的重组DNA分子。在进行DNA重组时,应用限制酶同时切割目的基因和载体DNA,使之产生相对的粘性末端,然后再将二者连接成重组DNA分子; 3)?平齐末端
SmaI 5’-CCCGGG-3’ 5’-CCC GGG-3’
3’-GGGCCC-5’ 3’-GGG CCC-5’
4)非互补的粘性末端
a)切点在识别顺序之外的,如:FokI
Fok I 5’-GGATG(N)9-3’ 5’-GGATG(N)9
3’-CCTAC(N)13-5’ 3’-CCTAC(N)13
b)能识别简并顺序的,如:AvaI
AvaI 5’-CPyCGPuG-3’
CCCGGG; C TCGGG; CCCGAG; CTCGAG ; ;5’NNNNNNNGAATTCNNNNNNNN3’
3’NNNNNNNCTTAAGNNNNNNNN5’; 5’NNNNNNGTTAACNNNNN3‘
3’NNNNNNCAATTGNNNNN5‘;酶切条件:酶切缓冲液;(四)、异源同序酶(isoschizomer,同裂酶);(五)、 限制酶的用途;酶切图谱的构建(a);酶切图谱的构建(b);二、DNA甲基化酶(一)、 甲基化酶的种类与识别顺序;2.???? II型甲基化酶对限制酶活性的影响
1) 抑制同种限制酶的活性
M.BamHI GGATmCC—BamHI(G?GATCC)
M.EcoRI GAmATTC—EcoRI(G?AATTC)
2) 抑制不同种限制酶的活性
a. 顺序完全重叠 如:M. ClaI(ATCGmAT)----TaqI(TCGmA)
b. 顺序边界重叠 如:M. BamHI(GGATmCC)----MepI(mCCGG)
3) 抑制不同种限制酶的部分活性
M.TaqI(TCGmA)---HindII(GTPyPuAC):GTCAAC,GTTAAC,GTCGmAC,GTTGAC
3.???? 甲基化酶的用途
1) 改变某些限制酶识别顺序的特异性,以便重组体的形成
2) 在建立基因文库时,可先使DNA分子部分甲基化,然后再用限制酶切;;三、核酸酶(一)、外切酶III(ExoIII); 3.??外切酶活性特点
1) 反应底物:互补ds-DNA
2) 碱基释放速度:CA-TG
3) 反应产物:5’-单磷酸核苷和具缺口或5’-端突起的ds-DNA,过度反应将导致DNA降解
4.??用途
1)??? 核酸(DNA)标记
2)??? 基因突变-
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