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高通量测序技术在无创产前诊断和植入前诊断中的应用 Application of next-generation sequencing in non invasive prenatal test and preimplantation genetic screeningDepartment of clinical laboratory测序技术一代测序技术:Sanger 测序二代测序技术:Massive Parallel Sequencing,next generation sequencing,High throughput sequencing 三代测序技术:单分子测序技术二代测序技术罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch GS FLX sequencer)--2013年停产Illumina公司的Solexa基因组分析仪(Illumina Genome Analyzer)ABI的SOLiD测序仪(ABI SOLiD sequencer)Library Preparation 1.5H7-8HReadsApplication of next-generation sequencing in Reproductive Genetic Health 95%+5%21 reads/ 1 reads =1211ApplicationAnueploidy(21,18,13)Copy number variantsPoint mutation,small indel Limitation of traditional screeningNIPTTraditional screeningNegative predict value 100%IndicationsContraindicationPGD and PGS描述对某一特定遗传病的检测,有严格的适应指征高通量测序应用于PGD,目前并不成熟3D 卵裂球5D 囊胚PGD and PGSPGS, Preimplantation Genetic Screening? PGS,?胚胎植入前基因筛查PGS主要针对高龄(>36周岁)、习惯性流产(流产次数>2次)、反复植入失败(>3次移植高质量胚胎或多次移植,胚胎总数>10的种植失败)对体外受精形成的胚胎进行染色体分析,将正常胚胎移植到待孕妇女的子宫。目的是提高ART治疗中预后不良妇女的助孕成功率,降低流产率,属于植入前遗传学诊断中针对遗传危险度较低人群的一项技术。PGS and NGSTechnology in PGS:FISH,array CGHSingle cell amplication多重置换扩增技术(multiple displacement amplification, MDA)多重退火环状扩增循环技术(multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC)DNA FragmentLibrary construction扩增偏倚,覆盖程度(90%)3D 卵裂球5D 囊胚ApplicationAnueploidy(21,18,13)Copy number variantsPoint mutation,small indel Overview2015年为NGS临床应用的元年商业市场火爆技术流程复杂,操作繁琐人员资质,设备投入要求高技术规范化和准入严苛监管部门谨慎认知落后于技术Thanks !
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