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全基因组Denovo测序解决方案 全基因组Denovo测序解决方案 全基因组De novo测序解决方案 全基因组De novo测序也叫做基因组从头测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组 进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。过去三 年，华大分别将黄瓜，大熊猫，白菜进行de novo测序，它的意义不仅在于发现新的基因和SNP位点，更在于 加深了我们对该物种的生长、发育、进化、起源等重大问题的认识，文章全部发表在nature genetics上。基于 此，我们推出De novo测序的完整解决方案，配合您一起探索生物奥秘。 ※ 实验技术流程 ※ 生物信息分析策略 1、基因组拼装统计 提供基因组拼装的基本信息，包括原始数据统计、测序覆盖率统计、Contig N50大小、Scaffold N50大 小、基因组GC含量等信息。 2、基因组注释 包括基因预测、基因功能注释（同NR、Swiss-Prot、Interpro等数据库进行同源比对）、重复序列分析及 Non-coding RNA注释等。 3、基因功能分类 GO分类、KEGG通路分析等。 4、比较基因组学及进化分析 通过比较相近物种的基因组数据，从基因功能、基因组骨架结构、分子进化等方面对目标基因组进行分析。 5、建立数据库 建立符合国际标准且具有良好兼容性的基因组数据库，实现基因组数据的查询与共享。 1、Rami A.D, et al., Multi-Platform Next-Generation Sequencing of the Domestic Turkey(Meleagris gallopavo): Genome Assembly and Analysis. PLOS Biology. 2021, 8（9）: e1000475. 2、Ruiqiang Li, et al., The sequence and de novo assembly of the giant panda genome. Nature. 2021, 463: 311-7. 3、Sanwen Huang, et al., The genome of the cucumber, Cucumis sativus L. Nature Genetics. 2021, 41(12):1275-81