检测链特异性效率的成套试剂与方法发明专利.pdfVIP

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 109385468 A (43)申请公布日 2019.02.26 (21)申请号 201710684356.5 (22)申请日 2017.08.11 (71)申请人 深圳华大基因股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三 街21号华大综合园7栋7层-14层 (72)发明人 宗亮　伍梓靖　姚秋林　谢梅英　 (74)专利代理机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 关畅 (51)Int.Cl. C12Q 1/6869(2018.01) C40B 50/06(2006.01) C12N 15/11(2006.01) 权利要求书2页 说明书5页 序列表2页 附图3页 (54)发明名称 检测链特异性效率的成套试剂与方法 (57)摘要 本发明公开了检测链特异性效率的成套试 剂与方法。本发明公开的检测链特异性效率的成 套试剂由SEQ ID NO:1-6所示的RNA组成，检测链 特异性效率的方法，包括：向待建库的RNA中添加 本发明的成套试剂，后进行链特异性转录组文库 构建，然后进行高通量测序，将测序数据与成套 试剂的序列进行比对，计算成套试剂的正义比对 读段数目占成套试剂的总读段数目的比例，该比 例即为链特异性系数，根据链特异性系数确定链 特异性效率。本发明的检测链特异性效率的方法 与成套试剂可以用于指示mRNA或非编码RNA等链 特异性转录组测序数据的可信程度，确保分析结 A 果的可靠性。 8 6 4 5 8 3 9 0 1 N C CN 109385468 A 权　利　要　求　书 1/2页 1.成套试剂，为名称分别为SCS1、SCS2、SCS3、SCS4、SCS5和SCS6的RNA中的至少一种； 所述SCS1为如下a1)至a4)中的任一种RNA： a1)序列表中SEQ  ID NO:1所示的RNA； a2)在a1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的RNA； a3)与a1)或a2)限定的RNA具有85％以上的同一性的RNA； a4)在严格条件下与a1)或a2)限定的RNA杂交的RNA； 所述SCS2为如下b1)至b4)中的任一种RNA： b1)序列表中SEQ  ID NO:2所示的RNA； b2)在b1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的RNA； b3)与b1)或b2)限定的RNA具有85％以上的同一性的RNA； b4)在严格条件下与b1)或b2)限定的RNA杂交的RNA； 所述SCS3为如下c1)至c4)中的任一种RNA： c1)序列表中SEQ  ID NO:3所示的RNA； c2)在c1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的RNA； c3)与c1)或c2)限定的RNA具有85％以上的同一性的RNA； c4)在严格条件下与c1)或c2)限定的RNA杂交的RNA； 所述SCS4为如下d1)至d4)中的任一种RNA： d1)序列表中SEQ  ID NO:4所示的RNA； d2)在d1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的RNA； d3)与d1)或d2)限定的RNA具有85％以上的同一性的RNA； d4)在严格条件下与d1)或d2)限定