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一种HPV精确分型的生物信息学分析方法及系统发明专利.pdfVIP

一种HPV精确分型的生物信息学分析方法及系统发明专利.pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 111032885 A (43)申请公布日 2020.04.17 (21)申请号 201780093704.X (74)专利代理机构 北京品源专利代理有限公司 11332 (22)申请日 2017.09.07 代理人 刘锴 周瑞 (85)PCT国际申请进入国家阶段日 (51)Int.Cl. 2020.02.06 C12Q 1/70(2006.01) (86)PCT国际申请的申请数据 PCT/CN2017/100927 2017.09.07 (87)PCT国际申请的公布数据 WO2019/047109 ZH 2019.03.14 (71)申请人 深圳华大基因股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三 街21号华大综合园7栋7层-14层 (72)发明人 柴相花 王书元 刘强 袁玉英  张红云 刘娜 尹烨  (54)发明名称 一种HPV精确分型的生物信息学分析方法及 系统 (57)摘要 本发明公开了一种HPV精确分型的生物信息 学分型方法及系统,所述方法包括:接收高通量 测序技术得到的测序片段,得到每个样本的 reads序列;将所有样本的reads序列进行分组聚 类,将聚类后的reads序列与HPV参考序列集进行 比对和筛选,确定筛选后的reads序列的匹配结 果;对确定HPV型别的reads序列采用LDA模型进 行HPV分型,最终确认每个reads序列的HPV型别。 A 5 8 8 2 3 0 1 1 1 N C

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