DNA复性动力学课件.pptx

DNA复性过程遵循二级反应动力学 DNA复性过程中单链消失的速度用公式表示：　　　　 -dC/dt=kC2　;1/C-1/ C0 = Kt ;不同DNA的Cot (1/2)值不同，与K值相关 DNA序列的复杂性影响K值: 在控制反应条件（初始浓度、温度、离子强度、片段大小）相同的前提下，DNA分子的C0t (1/2)值，取决于核苷酸的排列复杂性。 DNA序列的复杂性(complexity) X：最长的没有重复序列的核苷酸对的数值。 X= K Cot1/2 ;复杂性X 1;原核生物Cot曲线的特点： 形状相似（跨越2-3个数量级），Cot（1／2）不相同 －－单一序列 只是复杂性不同 高度重复序列Cot (1/2)值小 单一排列序列Cot (1/2)) 大 poly(A) X=1 Cot(1/2)=2x10-6 T4 X=1.7x105 Cot(1/2)= 0.3;P74图－16;2 重复序列(repetitive sequences);1）单拷贝序列(single copy sequences) 又称非重复序列： 一个基因组中只有一个拷贝。 慢复性速度 单一序列的复性曲线常只有一个拐点，而重复序列常有多个拐点。 结构基因 (蛋白质基因)大多是单拷贝序列。;大部分结构基因位于非重复的DNA序列内;2）轻度重复序列(light repetitive sequences);3）中度重复序列(moderate repetitive sequences);rDNA gene family;有AluⅠ酶切位点（AG/CT）而得名。;真核生物的 Alu family;还有许多其它家族如： KpnⅠ家族、 Hinf家族、 多聚dＴ-dＧ家族等。;4）高度重复序列(highly repetitive sequences);卫星 DNA序列(satellite DNA);卫星DNA：这类高度重复序列的碱基组成不同与其他部分，浮力密度也不同，用等密度梯度离心法可将其与主体DNA分开 。;卫星DNA的分类;卫星DNA的分类;不同生物的非重复基因占基因组的比例差别很大；;基因家族;Histone gene family;假基因（pseudogene）：具有与功能基因相似的序列，但由于有许多突变以致失去了原有的功能，所以假基因是没有功能的基因，用ψ表示。 来源：一般认为是由mRNA反转录成cDNA，然后整合在基因组中; 散布的基因家族（interspersed gene family）; 两种亚基的编码基因分别形成两个不同的基因簇，并存在于不同的染色体上.;2) 广义的基因家族;基因外的重复序列;2) 散布的重复DNA;A 短分散片段（short interspersed repeated segments, SINES）;B 长分散片段（long interspersed repeated segments, LINES）;;名词解释 基因组 C-值矛盾 基因家族 基因簇 段裂基因 卫星DNA 简答题 1. 根据复性动力学曲线判断真核生物各种序列类型 2. 真核、原核生物基因组特点的比较。