(可直接使用)分子生物学 第五章.ppt

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染色质化学组成 染色质DNA:携带遗传信息 染色质蛋白质 1〕组蛋白:与DNA非特异性结合 2〕非组蛋白:与DNA特异性结合,DNA结合蛋白 a)种类多样 b)功能多样 c)对DNA具有识别特异性 0.0 * 181h, DNA结合蛋白 0.0 * 181h, DNA结合蛋白的构造特征—以转录因子为例 转录因子的三个构造组成局部 1〕DNA结合构造域〔分类依据〕 2〕连接域 3〕转录活化构造域 0.0 * 181h, DNA结合构造域常见类型 螺旋-转角-螺旋把戏(helix-turn-helix motif, HTH, 图A) 锌指把戏(zinc finger motif, 图B,C) 亮氨酸拉链把戏(Leucine zipper motif,图D) 螺旋-环-螺旋把戏(heliex-loop-helix motif, 图E) HMG框把戏(HMG box motif,图F) 0.0 * 181h, 第四节 转录起始中DNA与蛋白质相互作用 0.0 * 181h, DNA-蛋白质相互作用是转录调控的方式 DNA: 顺式调控元件(cis-regulating element),是指对基因表达有调控活性的DNA 序列,其活性只影响与其自身同处于一个DNA分子上的基因. 蛋白质:反式作用因子(trans-acting factor)是通过识别和结合顺式调控元件的核心序列而调控靶基因转录效率的一组蛋白质. 0.0 * 181h, 顺式调控元件 启动子(promoter) 增强子(enhancer) 负调控元件—寂静子(silencer) 绝缘子 其它顺式调控元件: 1〕应答元件(responsive elements) 真核细胞中对某些特定的环境作出应答的基因,常具有一样的顺式元件—应答元件. 应答元件能被在一些特定情况下表达的调控因子识别(又称为可诱导的顺式调控元件/反式作用因子)。 2〕转座元件 0.0 * 181h, 启动子(promoter) 与基因转录启动有关的一组DNA 序列,一般位于转录起始点上游100-200bp 以内,其功能是决定转录的起始点和调控转录频率. 原核启动子: 1〕-35框: 5’-TTGACA-3’ 2〕-10框 5’-TATAAT-3’ 0.0 * 181h, 真核启动子 真核启动子区域包括核心启动子和启动子上游近侧序列: 1、核心启动子(core promoter) 是决定转录起始位置的关键序列,也是普通转录因子TFⅡD 的结合位点, ①TATA 盒(TATA box) 位于转录起始点上游-25~-30bp. ②起始子(initiator,Inr) Inr 是与转录起始位点重叠的短的较保守序列. 注:①不是所有基因都含有 TATA 盒或Inr 序列.有的只有其中之一,有的两者都无. ②这些核心启动子的序列和它们之间的间隔多变 2、上游启动子元件(Upstream Promoter element,UPE) 位于较上游(-30 一-110bp),能较强影响转录起始的频率,如CAAT 盒和GC 盒.其中GC盒是转录因子SPl 的结合位点。 0.0 * 181h, 增强子(enhancer) 能显著提高基因转录效率的一类顺式调控元件〔其核心序列常为8-12bp). 增强子的作用特点: 1〕能(通过启动子)提高同一条链上的靶基因转录速率; 2〕增强子对同源基因或异源基因同样有效; 3〕增强子的位置可在基因5’-上游、基因内或3’下游序列中; 4〕自身没有5’-或3’-方向性; 5〕增强子可远离转录起始点(最多30Kb); 6〕增强子一般具有组织或细胞特异性. 0.0 * 181h, RNA聚合酶 RNA 聚合酶I, 转录28S, 5. 8S 和18S 核糖体 RNA (rRNA) RNA 聚合酶Ⅱ,负责真核生物蛋白编码基因和大局部小核RNA〔snRNA)的转录,有7-10 个亚基,最大亚基的羧基末端构造域(CTD)具有7 个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Set)的重复序列,其中有多个磷酸化位点.CTD 磷酸化对调控基因转录有重要作用. RNA 聚合酶III,转录tRNA, 5S rRNA, U6-snRNA, 小核仁RNA (snoRNA), 小细胞质 RNA (seRNA) 0.0 * 181h, 根底转录因子(basal transcription factor) 真核基因转录除 RNA 聚合酶外,还需要许多蛋白因子—转录因子参加,其中一些转录因子是RNA 聚合酶Ⅱ转录起始必需的,并且可以维持根底水平的转录,因此称为根底转录因子或普通转录因子(genera

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