分子遗传学遗传多态性.ppt

分子遗传学遗传多态性;分子遗传学; 基因组多态性; DNA分子标识是DNA水平上遗传多态性直接反应.DNA水平遗传多态性表现为核苷酸序列任何差异,哪怕是单个核苷酸变异.所以,DNA标识在数量上几乎是无限.;DNA遗传标识特点: 1.直接反应基因特征, 非推测。 2.基因座位数量多, 不管表示是否。 3.多态性程度高, 等位基因多, 判别能力强。 4.适合于陈旧样品, 检测能力强。 5.灵敏度高, 有利于微量样品检测。 6.易于检测手段自动化、标准化, 反复性好。逐步替换了蛋白质水平检测方法。 ;DNA多态性分类 1）长度多态性: 等位基因片段长度个体差 别。由一特定序列, 首尾相连串联 反复次数不一样产生个体差异。 可变数目串联反复（variable number of tandem repeat,VNTR） 短串联反复(short tandem repeat,STR) A: 产生原因: DNA滑动与同源染色体 不等交换。;2）序列多态性: DNA片段碱基排列次序个体差异。 单核苷酸多态性 （single ucleotidepolymorphism,SNPs） 原因: 碱基置换、插入、缺失。 特点: 多位于非编码区, 选择压力。 数量多, 1/1000 bp, 300万 二态性, 2个等位基因, 多态性 程度较低。 孤立事件, 人类遗传学意义大。;DNA标识分类;(2)基于PCRDNA标识. 依据PCR所用引物特点,这类DNA标识可分为随机引物PCR标识和特异引物PCR标识.随机引物PCR标识包含RAPD标识和ISSR等,随机引物PCR所扩增DNA区段事先未知,含有随意性和任意性,所以随机引物PCR标识技术可用于对任何未知基因组研究.特异引物PCR标识包含SSR标识和STS标识等,特异引物PCR所扩增DNA区段事先是已知明确,含有特异性.所以特异引物PCR标识技术依靠于对各个物种基因组信息了解.;;;基于遗传标识发展历程;经典遗传标识（蛋白质和免疫学标识） ABO血型位点标识 HLA位点标识（人类白细胞抗原） 存在问题: 已知多态蛋白质极少 等位基因数目有限 无法取得足够信息量 检测技术繁琐等 —限制了人类基因组遗传分析工作 —促进大家直接在DNA上寻求遗传标识;蛋白质和免疫学标识;同工酶多态性;遗传标识中第一代标识;限制性片段长度多态性DNA基础 （1） 识别部位点突变: 碱基替换、修 饰（甲基化）或插入与缺失。 （2） 识别部位间片段插入与缺失。 （3）?识别部位间反复序列数目改变。; DNA限制性内切酶 restriction endonuclease 能够识别特定DNA序列, 与DNA分子结合后在特定部位将DNA双链切断核酸水解酶。 （1）生物学功效: 水解核酸磷酸二酯键。 （2）命名: 依据微生物种（第一个字母大 写）、属（前二个字母小写）、变种第一个 字母大写）、发觉分离次序（罗马数字）。 （3）分类: A: Ⅰ型: 远离识别部位随即切割, 非特异。 B: Ⅱ型: 在识别部位内部切割, 特异。 C: Ⅲ型: 在识别部位后定点切割, 特异。 单位: 1U: 在标准条件下, 1h完全水解1μgλ噬菌体酶量。 ;Ⅱ型DNA限制性内切酶: A: 识别核酸序列数目4-6个。 B: 识别序列为回纹序列。 C: 切割后产生末端分为粘行末端与平 末端。 例: PstⅠ 5ˊ-C↓TGCAG-3ˊ 3ˊ-GACGT↑C-5ˊ HaeⅢ 5ˊ-GG↓CC-3ˊ 3ˊ-CC↑GG-5ˊ;分型法: RFLP标识是发展最早DNA标识技术。 RFLP技术关键包含以下基础步骤: DNA提取　　　用限制性内切酶酶切DNA 、 　　　用凝胶电泳分开DNA片段　　　把DNA片段转移到滤膜上　　利用放射性标识探针杂交显示特定DNA片段（Southern杂交）和结果分析。 ;特点 A 无表型效应,