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课程学习报告: Molecular Dynamics(分子动力学) ;本节课汇报分四个内容;一 MD 简介;分子模拟的优势;2 增进安全性;3 实现通常条件下难以或无法进行的实验;2 分子模拟原理;;
虽然基于量子力学的从头算(ab initio)非常精确,但计算效率非常低,所计算的系统通常不超过100个原子。因此,量子力学的方法适用于简单的分子或电子数量较少的体系。而对于生化分子,聚合物等含大量原子及电子的系统,量子力学方法很难求解。
为此,科学家们发展了分子模拟方法。
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蒙特卡洛(MC)方法:通过系统中质点的随机运动,结合统计力学的概率分配原理,来得到体系的统计及热力学性质。
优点:不涉及时间时间效应,可以模拟平衡态。
缺点:只能计算统计平均值,不能得到动态信息。 而且粒子随机运动不符合物理学运动原理。
分子动力学(MD)方法:是应用分子力场及根据牛顿运动原理所发展的计算方法。
优点:系统中粒子运动有正确物理依据,准确性高,可以获得系统动态性质。
缺点:无法模拟时间较长的运动问题。;二 统计力学基础知识 统计力学:根据对物质微观结构及微观粒子相互作用的认识,用概率统计的方法,认为表征系统宏观性质的宏观量是大量微观粒子的统计平均值。统计力学是分子模拟的基础。;;;;2 系综;;;;;;;;;三 力场基础知识;;;;;;;6 交叉作用项;四 分子间势的发展;;;;;;;;
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