生物化学-第二章-中.ppt

纤维状蛋白质— 二级结构基础上形成的,多数是提供支持\形状和外部保护的支架 纤丝 原纤维 卷曲螺旋 α-角蛋白 中间丝 初原纤维 原纤维 丝心蛋白(β-角蛋白) 蚕丝和蜘蛛丝的一种蛋白 是β折叠富含Gly、Ala、Ser。每隔一个残基就是一个Gly,牢固但不能拉伸。 片间连接是通过大量弱的相互作用维持。 丝心蛋白和其他β-角蛋白：β折叠片蛋白质 丝心蛋白和其他β-角蛋白：β折叠片蛋白质 胶原蛋白： 胶原蛋白的二级结构是由三条肽链组成的三股螺旋 胶原蛋白： 胶原蛋白的二级结构是由三条肽链组成的三股螺旋，一级结构分析表明，?肽链的96%都是按三联体的重复顺序：(g1y-x-y)n排列而成。Gly数目占残基总数的三分之一，x常为Pro，y常为Hpro(羟脯氨酸)和Hlys（羟赖氨酸）。 氨基酸之间距离为0.29 nm 胶原分子的α链间以及纤维的胶原分子间通过独特的共价键方式交连,年龄大,交连多胶原蛋白之间的交联键会增多。 使骨头变硬而脆 　在蛋白质分子中，由若干相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。几种类型的超二级结构：α α；βαβ；βββ． 　　★超二级结构在结构层次上高于二级结构，但没有聚集成具有功能的结构域． 五 蛋白质的超二级结构和结构域 多肽链在二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域,域通常是几个超二级结构的组合。 对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成三级结构。这种相对独立的三维实体就称结构域。　 结构域 　 对于较小的蛋白质分子，结构域与三级结构等同，即这些蛋白为单结构域。 结构域一般由100~200 个氨基酸残基组成，但大小范围可达 40~400 个残基。氨基酸可以是连续的，也可以是不连续的． 结构域 结构域之间常形成裂隙，比较松散，往往是蛋白质优先被水解的部位。酶的活性中心往往位于两个结构域的界面上． 结构域之间由“铰链区”相连，使分子构象有一定的柔性，通过结构域之间的相对运动，使蛋白质分子实现一定的生物功能。 在蛋白质分子内，结构域可作为结构单位进行相对独立的运动，水解出来后仍能维持稳定的结构，甚至保留某些生物活性． 结构域 在二级结构、超二级结构和结构域的基础上，多肽链进一步折叠卷曲形成复杂的分子结构。 六 蛋白质的三级结构 球状蛋白质与三级结构 球状蛋白质的分类 : 1. 全α结构(反平行α螺旋) 蚯蚓肌红蛋白 子宫珠蛋白 流感病毒血凝素 烟草花叶病毒蛋白 球状蛋白质 球状蛋白质的分类 : 2. α , β-结构 球状蛋白质的分类 : 3. 全β-结构 胰岛素 磷脂酶A2 高氧还势铁蛋白 铁氧还蛋白 球状蛋白质的分类 : 4. 富含金属或二硫键结构 1.含多种二级结构元件; 2.具有明显的折叠层次; 3.球蛋白分子是紧密近似球状的实体; 4.疏水侧链在分子内部,亲水侧链在分子表面; 5.分子表面有空穴,是结合底物,效应物等配体,行使生物学功能的活性部位,空穴通常是一个疏水的区域。 ** 球状蛋白质三维结构的特征 第一节 蛋白质的构件-氨基酸 第二节 蛋白质的共价结构 第三节 蛋白质的三维结构 第四节 结构与功能的关系 第五节 蛋白质的通性、纯化 和表征 一 研究蛋白质构象的方法 二 稳定蛋白质三维结构的作用力 三 多肽主链折叠的空间限制 四 蛋白质的二级结构 五 蛋白质的超二级结构和结构域 六 蛋白质的三级结构 七蛋白质的四级结构 八蛋白质的折叠和结构预测 第三节 蛋白质的三维结构 目前研究构象的主要方