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专业班级:2018164 学号: 201816406 姓名:张锦渊
实验7: 谱聚类
一、实验目的
了解谱聚类的构建过程和代码实现,应用谱聚类解决简单的实际问题。
二、实验准备
安装python和pycharm,了解python基础编程和pycharm使用。
三、实验内容
基于程序中生成的数据,补充完整下面谱聚类算法相关程序,粘贴运行成功的结果截图,并给每行程序添加注释。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn import datasets
def calculate_w_ij(a,b,sigma=1):
w_ab = np.exp(-np.sum((a-b)**2)/(2*sigma**2)) #高斯相似度,距离远,相似度小
return w_ab
def Construct_Matrix_W(data,k=5): # 计算临接矩阵
rows = data.shape[0] #data矩阵行数
W = np.zeros((rows,rows)) #初始化方阵
for i in range(rows): #遍历矩阵
for j in range(rows):
if(i!=j):
W[i][j] = calculate_w_ij(data[i,:],data[j,:]) #调用函数处理W矩阵
t = np.argsort(W[i,:]) #将W中i行的元素从小到大排列,提取其对应的索引
for x in range(rows-k): #处理W矩阵
W[i][ t[x] ] = 0
W = (W+W.T)/2 #主要是想处理可能存在的复数的虚部,都变为实数
return W
def Calculate_Matrix_L_sym(W): # 计算标准化拉普拉斯矩阵
degreeMatrix = np.sum( W , axis=1 ) #按行求和
L = np.diag(degreeMatrix) - W #求出矩阵对角线元素减去W的结果
#拉普拉斯矩阵标准化,就是选择Ncut切图
sqrtDegreeMatrix = np.diag(1.0 / (degreeMatrix ** (0.5))) # D^(-1/2)
L_sym = np.dot(np.dot(sqrtDegreeMatrix, L), sqrtDegreeMatrix) # D^(-1/2) L D^(-1/2)
return L_sym
# 归一化
def normalization(matrix):
sum = np.sqrt(np.sum(matrix**2,axis=1,keepdims=True)) #按元素确定数组的正平方根
nor_matrix = matrix/sum #求商
return nor_matrix
def showCluster(res, k): #绘制聚类结果函数
m,n = res[:,0:2].shape #m,n为(800, 2)
mark =[or,ob, og, ok, oy]
if k len(mark): #错误处理
print(k值太大了)
return 1
for i in range(m): #绘制所有样本
markIndex = int(res[i,2]) #
plt.plot(res[i, 0], res[i, 1], mark[ markIndex ])
plt.show()
if __name__==__main__:
data,y= datasets.make_moons(n_samples=800, shuffle=True, noise=0.05, random_state=None)
W = Construct_Matrix_W(data) #根据样本数据计算临接矩阵
L_sym = Calculate_Matr
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