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质粒的基本知识
染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,
共价闭合环状,超螺旋
具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中
保持恒定的拷贝数,并表达所带的遗传信息。
质粒的存在使宿主具有一些额外的特性,
如对抗生素的抗性等。
质粒拷贝数
质粒种类 拷贝数 复制起始点 拷贝类型
质 粒
pUC18/19 载体 500–700 pMB1 高拷贝
pBluescript载体 300–500 ColE1 高拷贝
pGM-T 载体 300–400 pMB1 高拷贝
pTZ载体 1000 pMB1 高拷贝
pBR322载体 15–20 pMB1 低拷贝
pACYC 及其衍生载
10–12 p15A 低拷贝
体
pSC101 及其衍生载
~5 pSC101 低拷贝
体
粘 粒
SuperCos 10–20 ColE1 低拷贝
pWE15 10–20 ColE1 低拷贝
抗生素
工作浓度
抗生素 贮液浓度 保存条件
严紧型质粒 松弛型质粒
氨苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 100μg/ml
羧苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 100μg/ml
氯霉素 34mg/ml(溶于无水乙醇) -20℃ 34μg/ml 170μg/ml
卡那霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml
链霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml
四环素 5mg/ml(溶于无水乙醇) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml
质粒DNA提取方法
碱裂解法
煮沸法
CsCl法
高浓度NaCl法
双相法(聚乙二醇、葡聚糖二相)
碱裂解法原理
根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA 的结构差异来实现分离。
在pH12-12.5 时,线性DNA 被彻底变性;共价闭环质粒DNA 变性但两条互补链仍
会紧密缠绕结合在一起。
当溶液恢复中性,质粒DNA迅速复性,染色体DNA不能复性,从而离心即可以把
变性的染色体DNA沉淀和蛋白-SDS复合物沉淀分离出来。
实验者关心的因素
质粒的纯度--与下游反应密切相
得率--根据个人需要选择不同的纯化量
速度/方便性
经济性
质粒DNA提取试剂盒
每个离心柱处理的菌液量依据不同试剂盒中的吸附柱类型而定
RNAase溶液(10mg/ml)
平衡液BL
溶液P1、P2、P3
漂洗液PW
洗脱缓冲液EB
吸附柱(CB3、CB4、CB5)
收集管
质粒DNA提取试剂盒
小提 小提中量 高纯度小提 高纯度小提质粒大提 酵母
中量
1-5ml 5-15ml 1-5ml 5-15ml
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