Rho1D4纯化体系:为重组膜蛋白提取设计.docx

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Rho1D4纯化体系:为重组膜蛋白提取设计 膜蛋白的重要性不言而喻,假如细胞膜是守护细胞的城墙,而膜蛋白就是站在城墙上的各司其职的士兵,肩负着把守城门、传递信号、运输物质等重要职责。膜蛋白一旦“失守”,就会造成细胞功能紊乱,进而引起组织和器官发生病变,使身体遭受病痛侵扰。这也就是为什么膜蛋白成为大多数重要的药物研究对象和靶点。 在人体蛋白中,有大约30%是膜蛋白,FDA批准的新药中,大多数都以膜蛋白为靶点,几乎所有的膜蛋白都是研究热点。然而让人吃惊的是,乐观估计,目前已经被透彻研究清楚结构的膜蛋白仅占膜蛋白总量的1%。 究其原因,是因为膜蛋白依附或横跨在细胞膜的磷脂双分子层上,使膜蛋白的表达、纯化、结晶和结构分析都有很大难度。由于非常难以获得高纯度的膜蛋白,进而解析它们的结构和功能,使根据膜蛋白结构设计药物的方法难以施展,而这种方法是目前开发药物有效的方法之一,因为药物要能有效治疗并且使副作用尽量减小,作用位点就必须精准。 很多科研人员想深入研究膜蛋白,希望攻克困扰人类的各种疾病,但由于提取高纯度目标膜蛋白并不便捷,从而影响研发进度。市面上有一些专用于膜蛋白提取的试剂盒,大多数只能提取某几种类型的膜蛋白,有些试剂盒用于提取膜总蛋白(包括质膜和细胞器膜蛋白)。 目前,有一种新型膜蛋白提取工具能够特异性亲和纯化重组膜蛋白,并具有高纯度、高特异性、高载量、温和提取的优点,是基于1980年科学家在牛眼视网膜中发现的一种命名为Rho1D4的氨基酸序列以及其对应的抗体来作为亲和标签纯化膜蛋白取得了非常好的效果,将Rho1D4抗体链接在琼脂糖或磁珠上,用于亲和层析带有Rho1D4标签的膜蛋白,能近乎完美的解决这些研究难题。 1)什么是Rho1D4? Rho1D4是指在牛眼视网膜细胞内的牛视紫红质C端的后九位氨基酸。Rho1D4得名于与该序列特异性结合的单克隆抗体1。与Rho1D4抗体结合的表位可以作为针对膜蛋白的高特异性纯化标记。 通过基因修饰可在欲研究的目标(膜)蛋白C端加上Rho1D4标记(如图1)。一旦加载上该序列,即可用装载有Rho1D4抗体的亲和基质去捕获目标蛋白,随后添加Rho1D4肽,通过竞争性结合基质抗体的方式来洗脱目标蛋白。采用这种方法,相比改变pH值等其他洗脱方式,更加地温和。 图1:假设有3个跨膜域的膜蛋白。Rho1D4标签加到膜蛋白C端,它的序列是T-E-T-S-Q-V-A-P-A 2)Rho1D4的历史 Rho1D4的表位和抗体配对于20世纪80年代被发现,当时科学家将Rho1D4抗体交联包被在琼脂糖凝胶上,用来纯化通过猴肾细胞表达的牛视紫红质。1,2 从那时起,Rho1D4系统开始被广泛的用于小量膜蛋白提取的研究中,包括GPCR(G蛋白偶联受体),ATP结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporter),溶质反向转运体和以及一种含四个跨膜域的膜蛋白。 3)Rho1D4系统的优势和用途 高纯度 Rho1D4系统包含:标签、抗体偶联亲和基质(琼脂糖或磁珠等)以及洗脱多肽。Rho1D4系统的优势在于抗体与抗原相互作用的高度特异性。表位序列和链长对结合至关重要。例如,将第三位丙氨酸替换成甘氨酸,即移去一个甲基基团,抗体将不再与表位结合。同样,完整的九个氨基酸标签会与Rho1D4抗体结合紧密,去除两个氨基酸则阻断结合。因此,含有与Rho1D4表位相似序列的蛋白引起的非特异性结合被尽量减少,因此回收蛋白的纯度非常高。(见表1)3,4,5,6,7,8 高回收量 而Rho1D4系统的另一个优势是洗脱目标蛋白的高回收率。包括细菌,酵母和哺乳动物细胞系在内的表达系统已经针对特定的GPCR和其他膜蛋白进行了优化。用Rho1D4系统纯化后的膜蛋白通过凝胶过滤以除去用于洗脱的多肽。使用此纯化系统的科研人员均反馈蛋白回收量均达到毫克级。(见表1)3,4,5,6,7,8 纯化的膜蛋白可用于功能性研究 纯化的蛋白可用于功能性研究,如配体结合的特性,蛋白与蛋白间的相互作用。例如,将标记过的ABCA4固定在载有Rho1D4抗体的基质上来确定它与天然配体(一种视网膜的加成物)的亲和结合特性,加入ATP后即释放2。又例如,CD81蛋白被整体固定在涂有Rho1D4抗体的平板上,它表现出和分离可溶蛋白片段与丙型肝炎病毒包膜E2蛋白相同的亲和结合力3。另外,有阴离子转运载体AE1结构域的重组蛋白被标记且用Rho1D4系统纯化后表现出与红细胞来源的AE1蛋白有相同的硫酸外排速率。 4)利用Rho1D4纯化膜蛋白图解简述 步骤1: 结合 将Rho1D4标记的蛋白与载有Rho1D4抗体的琼脂糖一同孵育使得目标蛋白被固定在吸附材料上。 ? 步骤2: 清洗 将杂蛋白和其他裂解液成分洗去,留下与亲和基质结合的目

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