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蛋白质双向电泳过程与体会 双向电泳IEF (sigma) IEF(not IPG)/SDS最简单的装备推荐如下,适合于没多少money做 IPG又想做“热”的所谓蛋白质组的,嘻嘻!
IEF用Biorad的圆盘电泳槽(不行用国产的吧,不推荐),SDS用六一厂的就可以了(ft, 六一厂应该给我money吧,给你做广告了)(money不是很多的强烈推荐六一的,买进口电泳 槽的钱留出来测搞出的差异蛋白质的序列吧,呵呵)BIO-RAD的圆盘电泳槽,国产的不推荐,因为上槽Biorad的钳金丝凹进去了 ?点,不是 很进去,而国产的凹得太进去了以至「?电聚焦时产生的气泡绕在钳金攵幺一圈,影响电聚焦。
双向电泳蛋白质样品制备
秧苗蛋白质样品的提取按Davermal等(1986)的方法进行。lOOmg材料剪碎后加入 10mgPVP-40(聚乙烯毗咯烷酮)及少量石英砂,用液氮研磨成粉,加入1.5 ml 10%三氯乙酸(丙酮配制,含10mM 即 0.07% B -
蔬基乙醇),混匀,-20C沉淀1小时,4°C, 15000 r/min离心15 min,弃上清,沉淀复溶于 1.5ml冷丙酮(含10 mM6?疏基乙醇),再于-20C沉淀1小时,同上离心弃上清,(有必要再 用80%丙酮(含10 mM B ?筑基乙醇所得沉淀低温冷冻真空抽干。
按每mg干粉加入20ul(可调)UKS液[9.5 M尿素,5mM碳酸钾,1.25%SDS, 0.5%DTT(二硫 苏糖醇),2% Ampholine (Amersham Pharmacia Biotech Inc, pH3.5-10), 6% Triton X-100], 37°C 育30min,期间搅动儿次,28度(温度低,高浓度的尿素会让溶液结冰)16000 r/min高心15 min,离心力越大时间长一点越好!上清即可上样电泳。或者-70度保存2蛋白质浓度测定
按Garrels(1983)的程序,稍加改动。10 u I ±述用UKS液制得的蛋白质样品中加入40」I水 及50 P I 20%三氯乙酸,冰浴30min后,4°C, 4000 r/min离心15min,弃上清,再加入100 P I冷丙酮,同上离心5min,弃上清,冻干獭,用100 口 I PBS溶液复溶,并按Bradford(1976) 的程序测定蛋白质浓度。说实话,好象Bradford法不太好做2.3.1 电聚焦(IEF)
玻管准备干7争玻管(18cmX1.5mm))IJ Parafilm封口膜封好底部,在16cm处作好标讪,垂直放在泡沫板 上。电聚焦的管子,买原装的也可以,实在不行自己也可以做的,1ml的移液管,内径1.5mm 左右的,长度取18cm,用玻璃刀做,呵呵,很容易的:玻璃管的处理,先用2M的NaOH泡 至少lhr,用自来水冲后;用双蒸水冲,用双蒸水泡至少Ihr,中间至少换2, 3次水;后用 2M的HCL泡至少1个小时,用双蒸水冲,(不能用自来水冲),然后双蒸水泡至少1个小 时,中间换3, 4次水,可多泡一会。最后泡在无水乙孵里
面lhr,轰干就可以用了.
凝胶制备与电聚焦灌IEF的配方
为3.09克尿素1.125 ml 10%NP-40
1.125ml 水0.735ml 30%屏息现案(ACR 28.38 BIS 1.62)
0.15 ml Am 3.5-100.375ml Am 5-7
8卫生10%AP1.8 卫生 TEMED
用注射器吸好胶液,装上7号针头,将7号针头插入玻管底部,边推注射器边提针头,直到 标记处,用微量进样器小心加入少量水,可见明显的界面出现,让其聚合1小时以I:,适当 长一点的时间好一些,我一般是头天卜,午灌胶,第2天卜?午才开始胞电泳。待胶聚合好后, 除去Parafilm并吸去顶部的覆盖液,加样80Ug,上面再小心加入50m mol/L NaOH至管口, 不要破坏样品与NaOH的界面。即可进行电泳。电极液为:上槽(负极)为50m mol/L NaOH液, 下槽(正极)为 25m mol/L H3PO4,按 200VX15min, 300VX30min, 400VX18h, lOOOVXlh 的程序进行电聚焦。或者直接 400V 17hr 1000V 2hr very important thing is跑第一向一定要在保持在37度左右,特别是冬天,我的方法是温控仪控制 暖风机在37度暖风机和电泳槽在 个大的纸箱(密封)里.呵呵,应该可以想象得到吧,第一 向温度特别重要,不然,电聚焦肯定做不好.
电泳后的凝条处理电聚焦完毕后,用注射器吸满水,套上一个200 ul的枪头,当然枪头与注射器间用parafilm 封住防漏气。从顶部向下注水使胶条向下滑出。当然,刚开始做的时候肯定不熟,很不爽, 有时候你会唱想哭却又哭不出来
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