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冷冻电镜数据的收集和监控
常圣海
冷冻电镜中心( CCEM )
浙江大学
Outlines
1. 冷冻电镜数据收集的相关设定--SerialEM
数据格式的选择
Super vs Counting mode
Multishot
2. 冷冻电镜数据的监控--Focus
1. Basic knowledge and related principles of cryoEM
1.1 why EM?
1.2 The principle of cryo-Sample preparation
1.3 The principle of 2D crystal diffraction
1.4 The principle of SPA
1.1 Why EM?
Abbe Limit :
δ=0.61λ/(nSinα),
Electron wavelengths (λ)
0.0037nm at 100kV
0.0025nm at 200kV
0.0020nm at 300kV
The limitation of EM for bio-sample
High vacuum
Electrons
interact
much more
Low transmission
strongly
with matter capacity
High radiation damage
The rules of EM sample preparation
•The thickness of the sample should be less
than 500nm
•The sample should be stable at high vacuum
•The sample should not be sensitive to
electron radiation
Conventional methods for EM sample preparation
conventional fixation embeding
and section negative staining
1.2 Vitreous ice
Cryo-EM specimen preparation is creating a
well-preserved sample in a thin, vitreous ice
Doubochet and his cryo-virus
Low dose imaging leads to low contrast
是 vs 足
1.3 2D crystal diffraction
是 vs 足
是 vs 足
是 vs 足
是 vs 足
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