一种基于GPU快速优化运算基因共表达网络方法.pdfVIP

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2023-04-22 发布于四川
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一种基于GPU快速优化运算基因共表达网络方法.pdf

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本发明公开了一种基于GPU快速优化运算基因共表达网络方法，属于互联网领域，包括以下步骤：步骤一：建立数据读取模块、相关性矩阵系数迭代模块和等级数值迭代模块，并用GPU提供算力，构建基因共表达网络；步骤二：利用数据读取模块进行读取输入文件的相关数据。引入了迭代思想，用旧值递推新值，使其能够适应不同条件下的基因共表达数据，进而构建加权关联网络并获得更具有生物学意义的结果；由于GPU具有多核心，将其运用在基因共表达网络分析上，用来处理基因共表达矩阵，能够大大减少分析周期，缩短分析等待时间。在此之上，需

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113920003 A (43)申请公布日 2022.01.11 (21)申请号 202111404214.1 (22)申请日 2021.11.24 (71)申请人南京