基于宏基因组拼接错误的检测校正系统.pdfVIP

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2023-04-27 发布于北京
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基于宏基因组拼接错误的检测校正系统.pdf

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本发明公开了基于宏基因组拼接错误的检测校正系统，涉及基因组测序拼接技术领域，解决了由于高通量测序数据的通量高，序列短，噪声大的特点，这就导致基因组的组装结果通常会引入组装错误，而组装错误也给下游分析带来影响的问题，通过利用提取的contig水平的相关特征建立的样本特征矩阵预测可能存在组装错误的contig，利用提取的短窗口水平的相关特征建立的窗口特征矩阵在基于无监督的预测方法下得到组装错误所在的具体位点；在预测到的组装错误所在具体位点处进行contig打断，从而进行校正，便能够检测出宏基因组组装

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114155914 A (43)申请公布日 2022.03.08 (21)申请号 202111451194.3 (22)申请日 2021.12.01 (71)申请人复旦大学地址 20