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DMol3基本原理和参数设置;SCF(DFT);Density Functional Theory;基于DFT的自洽计算过程 ;DFT和磁学性能;Dmol3的基本原理和参数设置;DMol3: 原子轨道线形组合法(LCAO); 在DMol3模块中,电子密度实际上由各个原子轨道的平方和来确定:;其中,动能项的方程为:
注意,动能项实际上是一个常数项,在第一次计算完成后,该数值基本上可以确定,后继计算中,则可以忽略这一步骤。
势能项处理:; 需要注意的是,在势能项中的电子-电子相互作用,指的是两个电子间的相互作用。但是,在整个体系中,还有三电子、四电子之间的相互作用,这一部分的内容从数学上是没有办法得到精确解的,在密度泛函理论中,将这一部分的内容归入了Exc这一项。
对这一项的处理,才是密度泛函理论处理的核心。针对不同的体系,有LDA和GGA两种处理方法。
LDA (Local density approximation)局域密度近似方法假定在原子尺度电子密度变化非常缓慢,也就是说,在整个分子区域内,整个体系表现为连续的电子气状态。
那么,整个电子交换-相关能就可以表示为对整个电子气的积分。
在DMol3模块中,常用的两种LDA方法是VWN和PWC:
VWN:最常用的LSD (Local spin density)相关势函数。用来拟和电子气的精确数值结果。
PWC:近期发展PWC泛函是在对VWN泛函的某些错误校正后的结果,是DMol3模块的默认泛函。
LSD方法可以精确预测共价体系的结构预测、频率计算和相关能量。但是,键能往往会高估。LDA方法不能用于处理弱健体系,如氢键。
LDA的这些缺陷,可以使用更大展开的Exc处理来校正。也称之为梯度校正方法。; GGA (General gradient-corrected)也成为NLSD(Non-local spin density)方法,近二十年来的计算工作表明,使用梯度校正交换-相关能Exc[ρ, d (ρ)]可以很好的描述分子体系的热力学性质。
需要注意的是,GGA方法实际上是一种经验性的描述函数。对于不同的研究体系,计算所使用的泛函的精确度实际上是不一样的。如果要求计算的结果准确可靠,则需要对相关的函数进行查阅,或者从相关文献中查找所使用的泛函。
P91, BP, BLYP, BOP:也称为广义梯度近似方法。一般??Becke交换函数(B88)与Perdew-Wang相关函数 (BP)或者Lee-Yang-Parr相关函数(BLYP)组合使用。
PBE:PBE (Perdew, Burke和Enzerhof) 泛函具有较强的物理背景,主要用于固体计算,可靠的数值计算性能,在DFT计算中经常被使用。交换项与Becke相类似,相关项与Pedew-Wang函数相接近。
RPBE:在PBE的基础上修改得到,对热力学计算结果较为可靠。
HCTH: 对无机物和氢键体系的热力学计算结果较为可靠。
VWN-BP:COSMO或者COSMO-RS计算推荐使用。
尽管NLSD计算比起LSD计算有很大的改善,但是,在计算反应能垒的时候,得到的能垒数据和实验结果相比仍任会有所低估。;Generalized Gradient Approximation (GGA); 当我们确定了如何处理电子的交换-相关能作用后,我们就可以将初始的薛定谔方程进行转换,转换后的Kohn-Sham方程就可以用下式来进行描述:
这里的Et是整个分子的总能量。而如果要精确的确定整个分子的总能量,就必须通过改变体系的电子密度ρ,并由此得到不同的能量数值,当体系的能量不再发生变化的时候,就可以认为整个体系趋于稳定,最终得到的能量,就是整个体系的最终能量。;选择初始的Ciμ。
根据Ciμ构建初始的分子轨道φi。
构建电子密度ρ。
使用电子密度,计算电子间的势能项,并考察Exc。
计算整个体系的哈密顿能量。
解自洽方程以获得新的一组Ciμ系数。
构建新的分子轨道φi和电子密度ρ
如果ρnew = ρold,那么通过新的薛定谔方程计算总能量,并结束。
如果ρnew ≠ρold,那么返回步骤4。
对于有机分子,一般10部左右可以保证整个ρnew – ρold 10-6,整个体系能量收敛。但是对于金属体系,一般需要更多的迭代来确保体系收敛。
;DMol
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